RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397098.7

C7orf50-202, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C7orf50, Length 2,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-202ENST00000397098 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.08■■■■■ 7.53
C7orf50-202ENST00000397098 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.59■■■■■ 6.17
C7orf50-202ENST00000397098 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.28■■■■■ 5.96
C7orf50-202ENST00000397098 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.44■■■■■ 5.83
C7orf50-202ENST00000397098 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.34■■■■■ 5.81
C7orf50-202ENST00000397098 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.23■■■■■ 5.79
C7orf50-202ENST00000397098 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.31■■■■■ 5.64
C7orf50-202ENST00000397098 ABCC9O60706 1549 aa50.24■■■■■ 5.63
C7orf50-202ENST00000397098 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.94■■■■■ 5.58
C7orf50-202ENST00000397098 NACADO15069 1562 aa49.81■■■■■ 5.57
C7orf50-202ENST00000397098 SCRIBQ14160 1630 aa49.59■■■■■ 5.53
C7orf50-202ENST00000397098 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.21■■■■■ 5.47
C7orf50-202ENST00000397098 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
C7orf50-202ENST00000397098 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.28■■■■■ 5.32
C7orf50-202ENST00000397098 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.23■■■■■ 5.31
C7orf50-202ENST00000397098 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.14■■■■■ 5.3
C7orf50-202ENST00000397098 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.05■■■■■ 5.28
C7orf50-202ENST00000397098 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
C7orf50-202ENST00000397098 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.76■■■■■ 5.24
C7orf50-202ENST00000397098 WIZO95785 1651 aa47.68■■■■■ 5.22
C7orf50-202ENST00000397098 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.66■■■■■ 5.22
C7orf50-202ENST00000397098 SMARCA4P51532 1647 aa47.52■■■■■ 5.2
C7orf50-202ENST00000397098 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.14
C7orf50-202ENST00000397098 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.86■■■■■ 5.09
C7orf50-202ENST00000397098 TRIM41Q8WV44 630 aa46.83■■■■■ 5.09
C7orf50-202ENST00000397098 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.78■■■■■ 5.08
C7orf50-202ENST00000397098 SMARCA2P51531 1590 aa46.75■■■■■ 5.07
C7orf50-202ENST00000397098 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
C7orf50-202ENST00000397098 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.61■■■■■ 5.05
C7orf50-202ENST00000397098 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.43■■■■■ 5.02
C7orf50-202ENST00000397098 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
C7orf50-202ENST00000397098 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
C7orf50-202ENST00000397098 ABCC8Q09428 1581 aa46.06■■■■■ 4.96
C7orf50-202ENST00000397098 NCAPD3P42695 1498 aa46.05■■■■■ 4.96
C7orf50-202ENST00000397098 HMGXB3Q12766 1538 aa45.97■■■■■ 4.95
C7orf50-202ENST00000397098 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.66■■■■■ 4.9
C7orf50-202ENST00000397098 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.48■■■■■ 4.87
C7orf50-202ENST00000397098 SOGA1O94964 1423 aa45.42■■■■■ 4.86
C7orf50-202ENST00000397098 SYNJ1O43426 1573 aa45.39■■■■■ 4.86
C7orf50-202ENST00000397098 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.39■■■■■ 4.86
C7orf50-202ENST00000397098 EEA1Q15075 1411 aa45.35■■■■■ 4.85
C7orf50-202ENST00000397098 CFTRP13569 1480 aa45.26■■■■■ 4.84
C7orf50-202ENST00000397098 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.2■■■■■ 4.83
C7orf50-202ENST00000397098 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.19■■■■■ 4.82
C7orf50-202ENST00000397098 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.15■■■■■ 4.82
C7orf50-202ENST00000397098 TOP2BQ02880 1626 aa45.11■■■■■ 4.81
C7orf50-202ENST00000397098 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.99■■■■■ 4.79
C7orf50-202ENST00000397098 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.98■■■■■ 4.79
C7orf50-202ENST00000397098 PRDM2Q13029 1718 aa44.88■■■■■ 4.78
C7orf50-202ENST00000397098 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
C7orf50-202ENST00000397098 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.85■■■■■ 4.77
C7orf50-202ENST00000397098 CUX1P39880 1505 aa44.85■■■■■ 4.77
C7orf50-202ENST00000397098 GOLGA3Q08378 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
C7orf50-202ENST00000397098 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
C7orf50-202ENST00000397098 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.72■■■■■ 4.75
C7orf50-202ENST00000397098 CEP162Q5TB80 1403 aa44.69■■■■■ 4.75
C7orf50-202ENST00000397098 KIF21BO75037 1637 aa44.68■■■■■ 4.74
C7orf50-202ENST00000397098 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.47■■■■■ 4.71
C7orf50-202ENST00000397098 KIF27Q86VH2 1401 aa44.43■■■■■ 4.7
C7orf50-202ENST00000397098 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.42■■■■■ 4.7
C7orf50-202ENST00000397098 HRCP23327 699 aa44.42■■■■■ 4.7
C7orf50-202ENST00000397098 NESP48681 1621 aa44.37■■■■■ 4.69
C7orf50-202ENST00000397098 PRXQ9BXM0 1461 aa44.31■■■■■ 4.68
C7orf50-202ENST00000397098 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.29■■■■■ 4.68
C7orf50-202ENST00000397098 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.25■■■■■ 4.67
C7orf50-202ENST00000397098 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.25■■■■■ 4.67
C7orf50-202ENST00000397098 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.24■■■■■ 4.67
C7orf50-202ENST00000397098 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
C7orf50-202ENST00000397098 CLIP1P30622 1438 aa44.17■■■■■ 4.66
C7orf50-202ENST00000397098 CUX2O14529 1486 aa44.15■■■■■ 4.66
C7orf50-202ENST00000397098 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.14■■■■■ 4.66
C7orf50-202ENST00000397098 TOPBP1Q92547 1522 aa44.06■■■■■ 4.64
C7orf50-202ENST00000397098 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.02■■■■■ 4.64
C7orf50-202ENST00000397098 IGF1RP08069 1367 aa44.01■■■■■ 4.64
C7orf50-202ENST00000397098 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
C7orf50-202ENST00000397098 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
C7orf50-202ENST00000397098 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.87■■■■■ 4.61
C7orf50-202ENST00000397098 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
C7orf50-202ENST00000397098 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.85■■■■■ 4.61
C7orf50-202ENST00000397098 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.84■■■■■ 4.61
C7orf50-202ENST00000397098 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.79■■■■■ 4.6
C7orf50-202ENST00000397098 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
C7orf50-202ENST00000397098 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.71■■■■■ 4.59
C7orf50-202ENST00000397098 ARAP1Q96P48 1450 aa43.59■■■■■ 4.57
C7orf50-202ENST00000397098 APLP2Q06481 763 aa43.57■■■■■ 4.56
C7orf50-202ENST00000397098 WDR97A6NE52 1622 aa43.51■■■■■ 4.56
C7orf50-202ENST00000397098 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.46■■■■■ 4.55
C7orf50-202ENST00000397098 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
C7orf50-202ENST00000397098 CUL7Q14999 1698 aa43.42■■■■■ 4.54
C7orf50-202ENST00000397098 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
C7orf50-202ENST00000397098 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.36■■■■■ 4.53
C7orf50-202ENST00000397098 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.36■■■■■ 4.53
C7orf50-202ENST00000397098 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.33■■■■■ 4.53
C7orf50-202ENST00000397098 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
C7orf50-202ENST00000397098 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
C7orf50-202ENST00000397098 WDR62O43379 1518 aa43.07■■■■■ 4.48
C7orf50-202ENST00000397098 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
C7orf50-202ENST00000397098 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.04■■■■■ 4.48
C7orf50-202ENST00000397098 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
C7orf50-202ENST00000397098 ERCC6Q03468 1493 aa42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms