RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630599.2

BRD4-212, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene BRD4, Length 726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-212ENST00000630599 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.03■■■■■ 7.68
BRD4-212ENST00000630599 ABCC9O60706 1549 aa57.09■■■■■ 6.73
BRD4-212ENST00000630599 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.7■■■■■ 6.67
BRD4-212ENST00000630599 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.17■■■■■ 6.26
BRD4-212ENST00000630599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.83■■■■■ 6.21
BRD4-212ENST00000630599 NACADO15069 1562 aa53.69■■■■■ 6.19
BRD4-212ENST00000630599 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.41■■■■■ 6.14
BRD4-212ENST00000630599 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.1■■■■■ 6.09
BRD4-212ENST00000630599 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.92■■■■■ 6.06
BRD4-212ENST00000630599 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.81■■■■■ 6.04
BRD4-212ENST00000630599 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.59■■■■■ 6.01
BRD4-212ENST00000630599 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.17■■■■■ 5.94
BRD4-212ENST00000630599 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.01■■■■■ 5.92
BRD4-212ENST00000630599 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.82■■■■■ 5.89
BRD4-212ENST00000630599 SCRIBQ14160 1630 aa51.7■■■■■ 5.87
BRD4-212ENST00000630599 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.53■■■■■ 5.84
BRD4-212ENST00000630599 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.45■■■■■ 5.83
BRD4-212ENST00000630599 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.33■■■■■ 5.81
BRD4-212ENST00000630599 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.67■■■■■ 5.54
BRD4-212ENST00000630599 NCAPD3P42695 1498 aa49.57■■■■■ 5.53
BRD4-212ENST00000630599 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.37■■■■■ 5.49
BRD4-212ENST00000630599 ERCC6Q03468 1493 aa49.32■■■■■ 5.49
BRD4-212ENST00000630599 CUX2O14529 1486 aa49.31■■■■■ 5.48
BRD4-212ENST00000630599 SMARCA4P51532 1647 aa49.25■■■■■ 5.47
BRD4-212ENST00000630599 SMARCA2P51531 1590 aa49.23■■■■■ 5.47
BRD4-212ENST00000630599 HMGXB3Q12766 1538 aa49.18■■■■■ 5.46
BRD4-212ENST00000630599 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.96■■■■■ 5.43
BRD4-212ENST00000630599 NESP48681 1621 aa48.94■■■■■ 5.43
BRD4-212ENST00000630599 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
BRD4-212ENST00000630599 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.74■■■■■ 5.39
BRD4-212ENST00000630599 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.58■■■■■ 5.37
BRD4-212ENST00000630599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.51■■■■■ 5.36
BRD4-212ENST00000630599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.35
BRD4-212ENST00000630599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.28■■■■■ 5.32
BRD4-212ENST00000630599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.25■■■■■ 5.32
BRD4-212ENST00000630599 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.05■■■■■ 5.28
BRD4-212ENST00000630599 WIZO95785 1651 aa47.99■■■■■ 5.27
BRD4-212ENST00000630599 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.87■■■■■ 5.25
BRD4-212ENST00000630599 WDR62O43379 1518 aa47.75■■■■■ 5.23
BRD4-212ENST00000630599 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.62■■■■■ 5.21
BRD4-212ENST00000630599 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.53■■■■■ 5.2
BRD4-212ENST00000630599 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
BRD4-212ENST00000630599 CFTRP13569 1480 aa47.43■■■■■ 5.18
BRD4-212ENST00000630599 TRIM41Q8WV44 630 aa47.41■■■■■ 5.18
BRD4-212ENST00000630599 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
BRD4-212ENST00000630599 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
BRD4-212ENST00000630599 OSCARQ8IYS5 282 aa47.01■■■■■ 5.12
BRD4-212ENST00000630599 PRDM2Q13029 1718 aa46.93■■■■■ 5.1
BRD4-212ENST00000630599 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.82■■■■■ 5.09
BRD4-212ENST00000630599 IFT140Q96RY7 1462 aa46.67■■■■■ 5.06
BRD4-212ENST00000630599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
BRD4-212ENST00000630599 TOPBP1Q92547 1522 aa46.59■■■■■ 5.05
BRD4-212ENST00000630599 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.46■■■■■ 5.03
BRD4-212ENST00000630599 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.46■■■■■ 5.03
BRD4-212ENST00000630599 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.46■■■■■ 5.03
BRD4-212ENST00000630599 ABCC8Q09428 1581 aa46.44■■■■■ 5.03
BRD4-212ENST00000630599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.39■■■■■ 5.02
BRD4-212ENST00000630599 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
BRD4-212ENST00000630599 ARHGEF11O15085 1522 aa46.27■■■■■ 5
BRD4-212ENST00000630599 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.98
BRD4-212ENST00000630599 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.986e-10■□□□□ 9.6
BRD4-212ENST00000630599 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
BRD4-212ENST00000630599 CHD1O14646 1710 aa46.08■■■■■ 4.97
BRD4-212ENST00000630599 FBLN2P98095 1184 aa45.97■■■■■ 4.95
BRD4-212ENST00000630599 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.96■■■■■ 4.95
BRD4-212ENST00000630599 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.94■■■■■ 4.95
BRD4-212ENST00000630599 SOGA1O94964 1423 aa45.88■■■■■ 4.94
BRD4-212ENST00000630599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
BRD4-212ENST00000630599 ARAP1Q96P48 1450 aa45.79■■■■■ 4.92
BRD4-212ENST00000630599 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.76■■■■■ 4.92
BRD4-212ENST00000630599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.71■■■■■ 4.91
BRD4-212ENST00000630599 WDR97A6NE52 1622 aa45.68■■■■■ 4.9
BRD4-212ENST00000630599 CUX1P39880 1505 aa45.66■■■■■ 4.9
BRD4-212ENST00000630599 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
BRD4-212ENST00000630599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
BRD4-212ENST00000630599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
BRD4-212ENST00000630599 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.54■■■■■ 4.88
BRD4-212ENST00000630599 GRIN2BQ13224 1484 aa45.52■■■■■ 4.88
BRD4-212ENST00000630599 SYNJ1O43426 1573 aa45.5■■■■■ 4.87
BRD4-212ENST00000630599 SYNJ2O15056 1496 aa45.41■■■■■ 4.86
BRD4-212ENST00000630599 PBRM1Q86U86 1689 aa45.32■■■■■ 4.85
BRD4-212ENST00000630599 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.31■■■■■ 4.84
BRD4-212ENST00000630599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.21■■■■■ 4.83
BRD4-212ENST00000630599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.18■■■■■ 4.82
BRD4-212ENST00000630599 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
BRD4-212ENST00000630599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.97■■■■■ 4.79
BRD4-212ENST00000630599 GRIN2AQ12879 1464 aa44.94■■■■■ 4.78
BRD4-212ENST00000630599 ADAMTS12P58397 1594 aa44.87■■■■■ 4.77
BRD4-212ENST00000630599 TOP2BQ02880 1626 aa44.83■■■■■ 4.77
BRD4-212ENST00000630599 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.83■■■■■ 4.77
BRD4-212ENST00000630599 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.83■■■■■ 4.77
BRD4-212ENST00000630599 CEP170Q5SW79 1584 aa44.81■■■■■ 4.76
BRD4-212ENST00000630599 NUP160Q12769 1436 aa44.78■■■■■ 4.76
BRD4-212ENST00000630599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.72■■■■■ 4.75
BRD4-212ENST00000630599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.63■■■■■ 4.73
BRD4-212ENST00000630599 SHROOM2Q13796 1616 aa44.63■■■■■ 4.73
BRD4-212ENST00000630599 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
BRD4-212ENST00000630599 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
BRD4-212ENST00000630599 JPH4Q96JJ6 628 aa44.33■■■■■ 4.69
BRD4-212ENST00000630599 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.25■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms