Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGGT1BP53609 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGGT1BP53609 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGGT1BP53609 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGGT1BP53609 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGGT1BP53609 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGGT1BP53609 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGGT1BP53609 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PGGT1BP53609 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PGGT1BP53609 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGGT1BP53609 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGGT1BP53609 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGGT1BP53609 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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