Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PGGT1BP53609 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PGGT1BP53609 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PGGT1BP53609 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PGGT1BP53609 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGGT1BP53609 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PGGT1BP53609 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PGGT1BP53609 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PGGT1BP53609 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PGGT1BP53609 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PGGT1BP53609 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PGGT1BP53609 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PGGT1BP53609 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PGGT1BP53609 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PGGT1BP53609 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PGGT1BP53609 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PGGT1BP53609 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGGT1BP53609 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PGGT1BP53609 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PGGT1BP53609 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PGGT1BP53609 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PGGT1BP53609 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PGGT1BP53609 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PGGT1BP53609 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PGGT1BP53609 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PGGT1BP53609 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PGGT1BP53609 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGGT1BP53609 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGGT1BP53609 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PGGT1BP53609 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PGGT1BP53609 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PGGT1BP53609 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PGGT1BP53609 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PGGT1BP53609 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PGGT1BP53609 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PGGT1BP53609 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PGGT1BP53609 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PGGT1BP53609 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PGGT1BP53609 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PGGT1BP53609 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PGGT1BP53609 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PGGT1BP53609 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGGT1BP53609 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGGT1BP53609 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGGT1BP53609 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGGT1BP53609 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PGGT1BP53609 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PGGT1BP53609 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PGGT1BP53609 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PGGT1BP53609 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGGT1BP53609 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PGGT1BP53609 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PGGT1BP53609 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PGGT1BP53609 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PGGT1BP53609 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PGGT1BP53609 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PGGT1BP53609 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PGGT1BP53609 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PGGT1BP53609 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PGGT1BP53609 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PGGT1BP53609 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PGGT1BP53609 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PGGT1BP53609 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PGGT1BP53609 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGGT1BP53609 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGGT1BP53609 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PGGT1BP53609 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PGGT1BP53609 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PGGT1BP53609 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PGGT1BP53609 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGGT1BP53609 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PGGT1BP53609 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PGGT1BP53609 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PGGT1BP53609 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PGGT1BP53609 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PGGT1BP53609 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGGT1BP53609 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGGT1BP53609 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGGT1BP53609 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGGT1BP53609 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PGGT1BP53609 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PGGT1BP53609 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGGT1BP53609 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGGT1BP53609 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGGT1BP53609 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGGT1BP53609 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGGT1BP53609 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGGT1BP53609 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGGT1BP53609 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PGGT1BP53609 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGGT1BP53609 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PGGT1BP53609 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PGGT1BP53609 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PGGT1BP53609 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGGT1BP53609 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGGT1BP53609 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGGT1BP53609 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGGT1BP53609 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PGGT1BP53609 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGGT1BP53609 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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