Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms