Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTL6BO94805 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTL6BO94805 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTL6BO94805 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTL6BO94805 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTL6BO94805 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTL6BO94805 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTL6BO94805 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms