Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTL6BO94805 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTL6BO94805 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTL6BO94805 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTL6BO94805 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTL6BO94805 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTL6BO94805 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTL6BO94805 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTL6BO94805 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTL6BO94805 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTL6BO94805 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTL6BO94805 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTL6BO94805 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTL6BO94805 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTL6BO94805 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTL6BO94805 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTL6BO94805 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTL6BO94805 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTL6BO94805 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTL6BO94805 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTL6BO94805 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTL6BO94805 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTL6BO94805 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTL6BO94805 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTL6BO94805 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTL6BO94805 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTL6BO94805 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTL6BO94805 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTL6BO94805 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTL6BO94805 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6BO94805 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTL6BO94805 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTL6BO94805 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTL6BO94805 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTL6BO94805 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTL6BO94805 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTL6BO94805 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTL6BO94805 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTL6BO94805 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTL6BO94805 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTL6BO94805 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTL6BO94805 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTL6BO94805 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTL6BO94805 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTL6BO94805 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTL6BO94805 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTL6BO94805 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTL6BO94805 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTL6BO94805 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTL6BO94805 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTL6BO94805 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTL6BO94805 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTL6BO94805 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTL6BO94805 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTL6BO94805 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6BO94805 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTL6BO94805 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTL6BO94805 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTL6BO94805 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTL6BO94805 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTL6BO94805 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTL6BO94805 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTL6BO94805 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTL6BO94805 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTL6BO94805 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTL6BO94805 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTL6BO94805 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTL6BO94805 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTL6BO94805 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTL6BO94805 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTL6BO94805 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTL6BO94805 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTL6BO94805 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTL6BO94805 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTL6BO94805 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTL6BO94805 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTL6BO94805 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTL6BO94805 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6BO94805 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTL6BO94805 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTL6BO94805 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTL6BO94805 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTL6BO94805 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTL6BO94805 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTL6BO94805 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTL6BO94805 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTL6BO94805 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms