Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PRG6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms