Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.025e-19■■□□□ 13.9
NOLC1Q14978 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC12.22□□□□□ -0.455e-19■■□□□ 13.9
NOLC1Q14978 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC12.06□□□□□ -0.485e-19■■□□□ 13.9
NOLC1Q14978 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.481e-14■■□□□ 13.9
NOLC1Q14978 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 521.8■■□□□ 1.084e-20■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 517.52■□□□□ 0.44e-20■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 514.91□□□□□ -0.024e-20■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FAT1-202ENST00000500085 2224 ntTSL 214.94□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FAT1-211ENST00000512772 1305 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.41□□□□□ -1.71e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 222.79■■□□□ 1.241e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 514.44□□□□□ -0.11e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 514.31□□□□□ -0.121e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 NOP56-218ENST00000496775 729 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 413.35□□□□□ -0.271e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.53□□□□□ -1.841e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-9■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-9■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RTFDC1-207ENST00000477573 2193 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.042e-9■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-9■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FAM209A-202ENST00000481560 666 ntTSL 56.26□□□□□ -1.412e-9■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.029e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.069e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.549e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 319.94■□□□□ 0.789e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.739e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 517.54■□□□□ 0.49e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 LINC01029-201ENST00000577408 1249 nt16.63■□□□□ 0.259e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 09e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.089e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.119e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.149e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.239e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.319e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 UFD1-206ENST00000466373 3059 ntTSL 212.23□□□□□ -0.459e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.59e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.69e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.859e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -12e-25■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.099e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.259e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.359e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.389e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.459e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 CFDP1-204ENST00000564793 457 ntTSL 35.87□□□□□ -1.479e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 CFDP1-209ENST00000570103 663 ntTSL 25.8□□□□□ -1.489e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 LINC01033-203ENST00000517934 306 ntTSL 22.13□□□□□ -2.079e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 226.03■■□□□ 1.763e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.583e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.313e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.653e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.273e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.53e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.153e-8■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 214.69□□□□□ -0.061e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.11e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.18e-7■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 310.97□□□□□ -0.651e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 310.86□□□□□ -0.671e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.26□□□□□ -1.251e-323■■□□□ 13.8
NOLC1Q14978 EEF1A1-209ENST00000495333 958 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-10■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 HSPA9-213ENST00000524109 1175 ntTSL 511.27□□□□□ -0.614e-9■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 RPL10A-204ENST00000478340 962 ntTSL 219.48■□□□□ 0.714e-9■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 RPL10A-205ENST00000490335 632 ntTSL 217.36■□□□□ 0.374e-9■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 RPL10A-203ENST00000467020 1069 ntTSL 316.28■□□□□ 0.24e-9■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 RPL10A-202ENST00000464112 1063 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.144e-9■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-9■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.819e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ERBB2-221ENST00000584888 500 ntTSL 319.49■□□□□ 0.719e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 216.45■□□□□ 0.229e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 215.61■□□□□ 0.099e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.049e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 KLF6-201ENST00000173785 925 ntTSL 214.77□□□□□ -0.059e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 314.45□□□□□ -0.19e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.129e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ERBB2-206ENST00000578373 4523 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.159e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.239e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.239e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 KLF6-205ENST00000492125 432 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.499e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 39.25□□□□□ -0.939e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 HUWE1-213ENST00000489876 754 ntTSL 48.88□□□□□ -0.999e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 TFRC-207ENST00000463356 533 ntTSL 37.33□□□□□ -1.249e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 TFRC-213ENST00000482479 540 ntTSL 36.25□□□□□ -1.419e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ACSL4-210ENST00000505855 587 ntTSL 45.34□□□□□ -1.551e-8■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 HNRNPU-208ENST00000475997 5290 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 HNRNPU-203ENST00000366527 12852 ntTSL 24.47□□□□□ -1.692e-6■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.92■■□□□ 1.586e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.316e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.89□□□□□ -1.151e-323■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 EIF4A2-213ENST00000465792 734 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-323■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 13.7
NOLC1Q14978 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 13.7
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 106.2 ms