Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -01e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CCT8-203ENST00000432178 556 ntTSL 23.51□□□□□ -1.851e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ANXA6-213ENST00000522664 451 ntTSL 511.51□□□□□ -0.571e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.041e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.767e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 KEAP1-206ENST00000590593 582 ntTSL 325.5■■□□□ 1.677e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.567e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.041e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-216ENST00000479525 1368 ntTSL 521.5■■□□□ 1.031e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NELFCD-208ENST00000482747 1701 ntTSL 221.07■□□□□ 0.967e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-214ENST00000548849 1028 ntTSL 320.95■□□□□ 0.947e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NELFCD-201ENST00000460601 2137 ntTSL 1 (best)20.78■□□□□ 0.927e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CAPN1-205ENST00000526954 754 ntTSL 520.49■□□□□ 0.877e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 KEAP1-210ENST00000592478 1044 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.787e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.77e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CAPN1-213ENST00000527897 879 ntTSL 319.24■□□□□ 0.677e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.491e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-229ENST00000551936 744 ntTSL 317.91■□□□□ 0.467e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NELFCD-205ENST00000477741 2070 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.427e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NELFCD-204ENST00000474543 2047 ntTSL 517.16■□□□□ 0.347e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 GALNT2-205ENST00000494106 692 ntTSL 516.94■□□□□ 0.37e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 01e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.057e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CAPN1-204ENST00000526468 690 ntTSL 314.42□□□□□ -0.17e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-221ENST00000550734 747 ntTSL 514.21□□□□□ -0.137e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 AKAP13-221ENST00000560579 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.427e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.437e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-205ENST00000546891 911 ntTSL 211.83□□□□□ -0.527e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 POLR1A-208ENST00000486964 1427 ntTSL 511.69□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 410.68□□□□□ -0.77e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 210.36□□□□□ -0.757e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 410.26□□□□□ -0.777e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 410.08□□□□□ -0.87e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-204ENST00000546621 1513 ntTSL 29.42□□□□□ -0.97e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.927e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.937e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-225ENST00000551253 676 ntTSL 38.5□□□□□ -1.057e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.061e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.077e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-208ENST00000436638 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.57□□□□□ -1.21e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.21e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 KEAP1-205ENST00000590237 451 ntTSL 26.81□□□□□ -1.327e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-215ENST00000475319 1543 ntTSL 26.8□□□□□ -1.321e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.421e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 55.95□□□□□ -1.461e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.467e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.57e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-204ENST00000368292 854 ntTSL 55.57□□□□□ -1.521e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.637e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 54.67□□□□□ -1.661e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CS-232ENST00000552331 526 ntTSL 24.17□□□□□ -1.747e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-217ENST00000488087 473 ntTSL 34.11□□□□□ -1.751e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECHDC1-205ENST00000368295 1966 ntTSL 53.93□□□□□ -1.781e-11■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CDC37-207ENST00000589755 793 ntTSL 225.46■■□□□ 1.675e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 GSTO1-206ENST00000493946 874 ntTSL 215.59■□□□□ 0.091e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.236e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 210.67□□□□□ -0.75e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 34.4□□□□□ -1.714e-8■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 217.09■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 510.56□□□□□ -0.721e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.078e-9■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.748e-9■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.58e-9■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 WDR1-207ENST00000504739 555 ntTSL 319.22■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 WDR1-210ENST00000506246 572 ntTSL 519.22■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 15.6
G3BP1Q13283 ECI1-204ENST00000563029 776 ntTSL 231.26■■■□□ 2.592e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.824e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NDUFS3-211ENST00000533507 1769 ntTSL 232.83■■■□□ 2.852e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.852e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NDUFS3-204ENST00000525378 779 ntTSL 214.48□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NDUFS3-203ENST00000525212 530 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 CTNNB1-205ENST00000426215 563 ntTSL 44.82□□□□□ -1.642e-9■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 APEX1-207ENST00000554325 568 ntTSL 515.8■□□□□ 0.126e-9■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 APEX1-217ENST00000557181 566 ntTSL 315.8■□□□□ 0.126e-9■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 46.74□□□□□ -1.337e-10■■■□□ 15.5
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