Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SIRT6-209ENST00000599365 1372 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-BMI1-201ENST00000417470 745 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SIRT6-212ENST00000600938 1473 ntTSL 213.42□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 313.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SLC19A1-208ENST00000468508 1435 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACAT1-208ENST00000531853 526 ntTSL 413.01□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-214ENST00000496071 1150 ntTSL 512.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ITGB3BP-212ENST00000489099 1285 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACAT1-207ENST00000531813 2258 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 TXNL1-206ENST00000587807 2035 ntTSL 212.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-BMI1-204ENST00000489125 329 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACTR6-213ENST00000553038 2045 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 DCTD-208ENST00000507631 879 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 COMMD3-203ENST00000448361 757 ntTSL 310.49□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SEH1L-208ENST00000590843 5206 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-205ENST00000463688 1407 ntTSL 510.26□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 CXorf56-201ENST00000320339 2372 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-223ENST00000543658 571 ntTSL 49.38□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CASP3-202ENST00000393585 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 GGPS1-201ENST00000282841 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CASP3-201ENST00000308394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-221ENST00000543162 575 ntTSL 48.43□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-222ENST00000543627 540 ntTSL 58.42□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 58.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACAT1-202ENST00000299355 1345 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CAP1-204ENST00000372798 1563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SERINC3-203ENST00000411544 812 ntTSL 37.98□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-206ENST00000535283 1220 ntTSL 27.93□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-214ENST00000539426 805 ntTSL 37.86□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 ITGB3BP-202ENST00000371092 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 30.7
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SUB1P53999 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-BMI1-203ENST00000475460 508 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACTR6-204ENST00000548180 1747 ntTSL 25.24□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 HADH-205ENST00000510728 751 ntTSL 34.81□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CNTRL-203ENST00000373845 3881 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-210ENST00000538129 475 ntTSL 24.56□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 TSG101-211ENST00000580814 441 ntTSL 24.46□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-BMI1-206ENST00000602395 621 ntTSL 24.31□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)4.3□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PPP2CB-209ENST00000523023 448 ntTSL 34.26□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACAT1-205ENST00000527942 493 ntTSL 44.14□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ATXN2-206ENST00000471866 836 ntTSL 44.08□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-BMI1-202ENST00000463409 605 ntTSL 34.02□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CAP1-219ENST00000494114 744 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 TSG101-212ENST00000584526 912 ntTSL 53.99□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-204ENST00000456711 748 ntTSL 33.95□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-212ENST00000479958 1443 ntTSL 23.89□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ITGB3BP-205ENST00000461681 1096 ntTSL 33.8□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 23.65□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SEPT11-216ENST00000515671 507 ntTSL 23.55□□□□□ -1.841e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.841e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ZFAND1-206ENST00000519338 891 ntTSL 33.33□□□□□ -1.881e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ITGB3BP-214ENST00000492655 589 ntTSL 23.21□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 30.7
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