RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.96■■■□□ 2.07
GGPS1-202ENST00000358966 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.08■■□□□ 1.45
GGPS1-202ENST00000358966 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GGPS1-202ENST00000358966 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.48■■□□□ 1.35
GGPS1-202ENST00000358966 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.43■■□□□ 1.34
GGPS1-202ENST00000358966 ABCC9O60706 1549 aa23.05■■□□□ 1.28
GGPS1-202ENST00000358966 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.87■■□□□ 1.25
GGPS1-202ENST00000358966 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GGPS1-202ENST00000358966 SCRIBQ14160 1630 aa22.56■■□□□ 1.2
GGPS1-202ENST00000358966 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.46■■□□□ 1.19
GGPS1-202ENST00000358966 NACADO15069 1562 aa22.43■■□□□ 1.18
GGPS1-202ENST00000358966 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.25■■□□□ 1.15
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GGPS1-202ENST00000358966 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.92■■□□□ 1.1
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GGPS1-202ENST00000358966 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.75■■□□□ 1.07
GGPS1-202ENST00000358966 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.71■■□□□ 1.07
GGPS1-202ENST00000358966 WIZO95785 1651 aa21.6■■□□□ 1.05
GGPS1-202ENST00000358966 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.54■■□□□ 1.04
GGPS1-202ENST00000358966 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GGPS1-202ENST00000358966 SMARCA4P51532 1647 aa21.46■■□□□ 1.03
GGPS1-202ENST00000358966 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
GGPS1-202ENST00000358966 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.11■□□□□ 0.97
GGPS1-202ENST00000358966 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.08■□□□□ 0.97
GGPS1-202ENST00000358966 SMARCA2P51531 1590 aa21.08■□□□□ 0.97
GGPS1-202ENST00000358966 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.04■□□□□ 0.96
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GGPS1-202ENST00000358966 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.94■□□□□ 0.94
GGPS1-202ENST00000358966 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
GGPS1-202ENST00000358966 ABCC8Q09428 1581 aa20.89■□□□□ 0.93
GGPS1-202ENST00000358966 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.84■□□□□ 0.93
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GGPS1-202ENST00000358966 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.72■□□□□ 0.91
GGPS1-202ENST00000358966 HMGXB3Q12766 1538 aa20.71■□□□□ 0.91
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GGPS1-202ENST00000358966 SYNJ1O43426 1573 aa20.52■□□□□ 0.88
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GGPS1-202ENST00000358966 NESP48681 1621 aa20.32■□□□□ 0.84
GGPS1-202ENST00000358966 CUX1P39880 1505 aa20.29■□□□□ 0.84
GGPS1-202ENST00000358966 TOP2BQ02880 1626 aa20.27■□□□□ 0.84
GGPS1-202ENST00000358966 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.26■□□□□ 0.83
GGPS1-202ENST00000358966 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.21■□□□□ 0.83
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GGPS1-202ENST00000358966 MYT1Q01538 1121 aa19.99■□□□□ 0.79
GGPS1-202ENST00000358966 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.99■□□□□ 0.79
GGPS1-202ENST00000358966 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.99■□□□□ 0.79
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GGPS1-202ENST00000358966 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.96■□□□□ 0.79
GGPS1-202ENST00000358966 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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GGPS1-202ENST00000358966 KIF27Q86VH2 1401 aa19.95■□□□□ 0.78
GGPS1-202ENST00000358966 TOPBP1Q92547 1522 aa19.95■□□□□ 0.78
GGPS1-202ENST00000358966 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.95■□□□□ 0.78
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GGPS1-202ENST00000358966 HRCP23327 699 aa19.85■□□□□ 0.77
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GGPS1-202ENST00000358966 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.75■□□□□ 0.75
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GGPS1-202ENST00000358966 WDR97A6NE52 1622 aa19.66■□□□□ 0.74
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GGPS1-202ENST00000358966 ERCC6Q03468 1493 aa19.64■□□□□ 0.74
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GGPS1-202ENST00000358966 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
GGPS1-202ENST00000358966 ARAP1Q96P48 1450 aa19.6■□□□□ 0.73
GGPS1-202ENST00000358966 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.6■□□□□ 0.73
GGPS1-202ENST00000358966 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
GGPS1-202ENST00000358966 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.58■□□□□ 0.73
GGPS1-202ENST00000358966 P3H3Q8IVL6 736 aa19.56■□□□□ 0.72
GGPS1-202ENST00000358966 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.55■□□□□ 0.72
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
GGPS1-202ENST00000358966 WDR62O43379 1518 aa19.52■□□□□ 0.71
GGPS1-202ENST00000358966 CUL7Q14999 1698 aa19.49■□□□□ 0.71
GGPS1-202ENST00000358966 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
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