RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489099.5

ITGB3BP-212, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGB3BP, Length 1,285 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGB3BP-212ENST00000489099 SMARCA2P51531 1590 aa33.78■■■■□ 3
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ITGB3BP-212ENST00000489099 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.17■■■□□ 2.9
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ITGB3BP-212ENST00000489099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.96■■■□□ 2.87
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ITGB3BP-212ENST00000489099 CHD1O14646 1710 aa31.46■■■□□ 2.63
ITGB3BP-212ENST00000489099 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.46■■■□□ 2.63
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ITGB3BP-212ENST00000489099 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.42■■■□□ 2.62
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ITGB3BP-212ENST00000489099 ARHGEF11O15085 1522 aa31.36■■■□□ 2.61
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ITGB3BP-212ENST00000489099 SHROOM2Q13796 1616 aa30.51■■■□□ 2.48
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ITGB3BP-212ENST00000489099 JPH4Q96JJ6 628 aa30.33■■■□□ 2.45
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