Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 317.37■□□□□ 0.373e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.343e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 UBL5-205ENST00000589372 1450 ntTSL 217.18■□□□□ 0.343e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 CHMP1A-204ENST00000547687 2007 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 POLD1-211ENST00000600746 999 ntTSL 516.63■□□□□ 0.253e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 AGRN-209ENST00000492947 690 ntTSL 216.13■□□□□ 0.173e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 POLD1-203ENST00000593887 695 ntTSL 515.71■□□□□ 0.113e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 POLD1-213ENST00000601098 783 ntTSL 315.66■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 LLGL1-202ENST00000479155 6004 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 CEP250-204ENST00000422671 2648 ntTSL 514.8□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 AL590096.1-201ENST00000615483 511 ntTSL 214.23□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 INTS6-209ENST00000483288 597 ntTSL 48.21□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 24.7
PRPF4O43172 INTS6-212ENST00000485178 474 ntTSL 54.05□□□□□ -1.761e-6■■■■□ 24.7
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PRPF4O43172 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-8■■■■□ 24.6
PRPF4O43172 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.073e-8■■■■□ 24.6
PRPF4O43172 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.35□□□□□ -1.073e-8■■■■□ 24.6
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PRPF4O43172 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-7■■■■□ 24.6
PRPF4O43172 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 24.6
PRPF4O43172 FAM126B-205ENST00000453765 536 ntTSL 415.64■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 24.6
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PRPF4O43172 FAM126B-201ENST00000286181 4778 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 24.6
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PRPF4O43172 FAM126B-204ENST00000452799 692 ntTSL 35.63□□□□□ -1.512e-7■■■■□ 24.6
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