RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.12■■■□□ 2.89
TNS3-211ENST00000474346 ABCC9O60706 1549 aa29.99■■■□□ 2.39
TNS3-211ENST00000474346 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.91■■■□□ 2.38
TNS3-211ENST00000474346 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.57■■■□□ 2.16
TNS3-211ENST00000474346 NACADO15069 1562 aa28.33■■■□□ 2.12
TNS3-211ENST00000474346 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.28■■■□□ 2.12
TNS3-211ENST00000474346 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.97■■■□□ 2.07
TNS3-211ENST00000474346 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.91■■■□□ 2.06
TNS3-211ENST00000474346 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
TNS3-211ENST00000474346 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.82■■■□□ 2.04
TNS3-211ENST00000474346 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.65■■■□□ 2.02
TNS3-211ENST00000474346 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.44■■□□□ 1.98
TNS3-211ENST00000474346 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.43■■□□□ 1.98
TNS3-211ENST00000474346 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TNS3-211ENST00000474346 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.12■■□□□ 1.93
TNS3-211ENST00000474346 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.1■■□□□ 1.93
TNS3-211ENST00000474346 SCRIBQ14160 1630 aa27.09■■□□□ 1.93
TNS3-211ENST00000474346 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TNS3-211ENST00000474346 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.29■■□□□ 1.8
TNS3-211ENST00000474346 NCAPD3P42695 1498 aa26.13■■□□□ 1.77
TNS3-211ENST00000474346 CUX2O14529 1486 aa26.09■■□□□ 1.77
TNS3-211ENST00000474346 ERCC6Q03468 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
TNS3-211ENST00000474346 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.96■■□□□ 1.75
TNS3-211ENST00000474346 SMARCA2P51531 1590 aa25.95■■□□□ 1.74
TNS3-211ENST00000474346 HMGXB3Q12766 1538 aa25.93■■□□□ 1.74
TNS3-211ENST00000474346 SMARCA4P51532 1647 aa25.88■■□□□ 1.73
TNS3-211ENST00000474346 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TNS3-211ENST00000474346 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TNS3-211ENST00000474346 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.69■■□□□ 1.7
TNS3-211ENST00000474346 NESP48681 1621 aa25.66■■□□□ 1.7
TNS3-211ENST00000474346 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.61■■□□□ 1.69
TNS3-211ENST00000474346 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TNS3-211ENST00000474346 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.46■■□□□ 1.67
TNS3-211ENST00000474346 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.45■■□□□ 1.66
TNS3-211ENST00000474346 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.38■■□□□ 1.65
TNS3-211ENST00000474346 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.31■■□□□ 1.64
TNS3-211ENST00000474346 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.21■■□□□ 1.63
TNS3-211ENST00000474346 WDR62O43379 1518 aa25.16■■□□□ 1.62
TNS3-211ENST00000474346 WIZO95785 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
TNS3-211ENST00000474346 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.06■■□□□ 1.6
TNS3-211ENST00000474346 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.99■■□□□ 1.59
TNS3-211ENST00000474346 CFTRP13569 1480 aa24.96■■□□□ 1.59
TNS3-211ENST00000474346 TRIM41Q8WV44 630 aa24.94■■□□□ 1.58
TNS3-211ENST00000474346 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TNS3-211ENST00000474346 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TNS3-211ENST00000474346 OSCARQ8IYS5 282 aa24.82■■□□□ 1.56
TNS3-211ENST00000474346 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TNS3-211ENST00000474346 PRDM2Q13029 1718 aa24.72■■□□□ 1.55
TNS3-211ENST00000474346 IFT140Q96RY7 1462 aa24.59■■□□□ 1.53
TNS3-211ENST00000474346 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.54■■□□□ 1.52
TNS3-211ENST00000474346 ABCC8Q09428 1581 aa24.54■■□□□ 1.52
TNS3-211ENST00000474346 TOPBP1Q92547 1522 aa24.48■■□□□ 1.51
TNS3-211ENST00000474346 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
TNS3-211ENST00000474346 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
TNS3-211ENST00000474346 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
TNS3-211ENST00000474346 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TNS3-211ENST00000474346 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.41■■□□□ 1.5
TNS3-211ENST00000474346 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TNS3-211ENST00000474346 ARHGEF11O15085 1522 aa24.38■■□□□ 1.49
TNS3-211ENST00000474346 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TNS3-211ENST00000474346 CHD1O14646 1710 aa24.24■■□□□ 1.47
TNS3-211ENST00000474346 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
TNS3-211ENST00000474346 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TNS3-211ENST00000474346 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.18■■□□□ 1.46
TNS3-211ENST00000474346 WDR97A6NE52 1622 aa24.16■■□□□ 1.46
TNS3-211ENST00000474346 FBLN2P98095 1184 aa24.13■■□□□ 1.45
TNS3-211ENST00000474346 SOGA1O94964 1423 aa24.11■■□□□ 1.45
TNS3-211ENST00000474346 ARAP1Q96P48 1450 aa24.09■■□□□ 1.45
TNS3-211ENST00000474346 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.07■■□□□ 1.44
TNS3-211ENST00000474346 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TNS3-211ENST00000474346 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.01■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 SYNJ1O43426 1573 aa23.99■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.98■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 GRIN2BQ13224 1484 aa23.96■■□□□ 1.43
TNS3-211ENST00000474346 CUX1P39880 1505 aa23.94■■□□□ 1.42
TNS3-211ENST00000474346 SYNJ2O15056 1496 aa23.91■■□□□ 1.42
TNS3-211ENST00000474346 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.82■■□□□ 1.4
TNS3-211ENST00000474346 PBRM1Q86U86 1689 aa23.82■■□□□ 1.4
TNS3-211ENST00000474346 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.78■■□□□ 1.4
TNS3-211ENST00000474346 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.74■■□□□ 1.39
TNS3-211ENST00000474346 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
TNS3-211ENST00000474346 GRIN2AQ12879 1464 aa23.63■■□□□ 1.37
TNS3-211ENST00000474346 ADAMTS12P58397 1594 aa23.57■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 NUP160Q12769 1436 aa23.57■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.55■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 TOP2BQ02880 1626 aa23.55■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.54■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 CEP170Q5SW79 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
TNS3-211ENST00000474346 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.5■■□□□ 1.35
TNS3-211ENST00000474346 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TNS3-211ENST00000474346 SHROOM2Q13796 1616 aa23.5■■□□□ 1.35
TNS3-211ENST00000474346 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.48■■□□□ 1.35
TNS3-211ENST00000474346 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TNS3-211ENST00000474346 JPH4Q96JJ6 628 aa23.31■■□□□ 1.32
TNS3-211ENST00000474346 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms