RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-210ENST00000578916 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.11■□□□□ 0.81
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PTPRM-210ENST00000578916 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-210ENST00000578916 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.19■□□□□ 0.66
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PTPRM-210ENST00000578916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.62■□□□□ 0.41
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PTPRM-210ENST00000578916 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
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PTPRM-210ENST00000578916 IFT140Q96RY7 1462 aa17.33■□□□□ 0.37
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PTPRM-210ENST00000578916 TOPBP1Q92547 1522 aa17.22■□□□□ 0.35
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PTPRM-210ENST00000578916 CHD1O14646 1710 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRM-210ENST00000578916 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRM-210ENST00000578916 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
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PTPRM-210ENST00000578916 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRM-210ENST00000578916 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.94■□□□□ 0.3
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PTPRM-210ENST00000578916 SYNJ2O15056 1496 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRM-210ENST00000578916 CUX1P39880 1505 aa16.8■□□□□ 0.28
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PTPRM-210ENST00000578916 NUP160Q12769 1436 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRM-210ENST00000578916 ADAMTS12P58397 1594 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 SHROOM2Q13796 1616 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 JPH4Q96JJ6 628 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.46■□□□□ 0.23
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PTPRM-210ENST00000578916 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-210ENST00000578916 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.43■□□□□ 0.22
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