RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ABCC9O60706 1549 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-210ENST00000578916 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.11■□□□□ 0.81
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PTPRM-210ENST00000578916 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-210ENST00000578916 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.54■□□□□ 0.72
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PTPRM-210ENST00000578916 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.48■□□□□ 0.71
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PTPRM-210ENST00000578916 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRM-210ENST00000578916 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.19■□□□□ 0.66
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PTPRM-210ENST00000578916 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.11■□□□□ 0.65
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PTPRM-210ENST00000578916 SCRIBQ14160 1630 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.91■□□□□ 0.62
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PTPRM-210ENST00000578916 HMGXB3Q12766 1538 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRM-210ENST00000578916 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRM-210ENST00000578916 WDR62O43379 1518 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRM-210ENST00000578916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.62■□□□□ 0.41
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PTPRM-210ENST00000578916 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
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PTPRM-210ENST00000578916 IFT140Q96RY7 1462 aa17.33■□□□□ 0.37
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PTPRM-210ENST00000578916 TOPBP1Q92547 1522 aa17.22■□□□□ 0.35
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PTPRM-210ENST00000578916 ARAP1Q96P48 1450 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRM-210ENST00000578916 CHD1O14646 1710 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRM-210ENST00000578916 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRM-210ENST00000578916 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PTPRM-210ENST00000578916 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
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PTPRM-210ENST00000578916 SOGA1O94964 1423 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRM-210ENST00000578916 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
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PTPRM-210ENST00000578916 GRIN2BQ13224 1484 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRM-210ENST00000578916 SYNJ2O15056 1496 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRM-210ENST00000578916 CUX1P39880 1505 aa16.8■□□□□ 0.28
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PTPRM-210ENST00000578916 NUP160Q12769 1436 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 CEP170Q5SW79 1584 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 ADAMTS12P58397 1594 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRM-210ENST00000578916 SHROOM2Q13796 1616 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 JPH4Q96JJ6 628 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-210ENST00000578916 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-210ENST00000578916 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-210ENST00000578916 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.43■□□□□ 0.22
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