Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-203ENST00000535297 395 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-7■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-208ENST00000545210 579 ntTSL 312.83□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-201ENST00000257262 468 ntTSL 39.23□□□□□ -0.932e-7■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-206ENST00000541893 517 ntTSL 55.7□□□□□ -1.52e-7■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 C9orf16-204ENST00000492588 1570 ntTSL 518.48■□□□□ 0.552e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 C9orf16-202ENST00000486420 434 ntTSL 513.46□□□□□ -0.252e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.197e-14■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.965e-12■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 GGA2-208ENST00000566685 571 ntTSL 417.87■□□□□ 0.457e-14■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.275e-12■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-12■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.095e-12■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 213.16□□□□□ -0.37e-14■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 310.67□□□□□ -0.77e-14■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.887e-14■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL41-201ENST00000358888 551 ntTSL 311.19□□□□□ -0.621e-15■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL41-206ENST00000552314 595 ntTSL 210.17□□□□□ -0.781e-15■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.951e-15■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-15■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 27□□□□□ -1.291e-15■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL41-205ENST00000546654 238 ntTSL 26.46□□□□□ -1.381e-15■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-212ENST00000490223 1785 ntTSL 220.65■□□□□ 0.95e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-206ENST00000422218 588 ntTSL 419.19■□□□□ 0.665e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.095e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-203ENST00000412097 562 ntTSL 511.77□□□□□ -0.535e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-207ENST00000434031 650 ntTSL 510.86□□□□□ -0.675e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-211ENST00000465786 1729 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.755e-13■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-205ENST00000444799 1590 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-206ENST00000449279 699 ntTSL 310.49□□□□□ -0.733e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 210.01□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.93e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 28.3□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 26.15□□□□□ -1.423e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 24.29□□□□□ -1.723e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 24.21□□□□□ -1.743e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.267e-11■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-11■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-211ENST00000523680 84 ntTSL 311.55□□□□□ -0.561e-8■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.681e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.051e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 512.2□□□□□ -0.461e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.155e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.155e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.675e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-212ENST00000530836 1613 ntTSL 522.13■■□□□ 1.135e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-208ENST00000527797 1609 ntTSL 521.95■■□□□ 1.15e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-209ENST00000528142 1821 ntTSL 321.08■□□□□ 0.975e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-205ENST00000526204 2120 ntTSL 520.7■□□□□ 0.95e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 220.67■□□□□ 0.95e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.835e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-207ENST00000526977 2036 ntTSL 519.69■□□□□ 0.745e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.735e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-213ENST00000530983 2337 ntTSL 518.42■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 PIP4K2A-205ENST00000474335 559 ntTSL 217.34■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.225e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-212ENST00000557260 856 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 310.29□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 210.03□□□□□ -0.85e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-207ENST00000554528 526 ntTSL 28.9□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-205ENST00000554089 932 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.045e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.125e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 37.69□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.365e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.45e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.525e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 34.73□□□□□ -1.655e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.915e-6■□□□□ 10.2
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