RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258091.9

CCT7-201, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCT7, Length 1,916 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7-201ENST00000258091 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.55■■■□□ 2.64
CCT7-201ENST00000258091 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.26■■□□□ 1.95
CCT7-201ENST00000258091 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CCT7-201ENST00000258091 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.13■■□□□ 1.77
CCT7-201ENST00000258091 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.03■■□□□ 1.76
CCT7-201ENST00000258091 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.8■■□□□ 1.72
CCT7-201ENST00000258091 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.63■■□□□ 1.69
CCT7-201ENST00000258091 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CCT7-201ENST00000258091 ABCC9O60706 1549 aa25.29■■□□□ 1.64
CCT7-201ENST00000258091 NACADO15069 1562 aa25.28■■□□□ 1.64
CCT7-201ENST00000258091 SCRIBQ14160 1630 aa25.1■■□□□ 1.61
CCT7-201ENST00000258091 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.92■■□□□ 1.58
CCT7-201ENST00000258091 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CCT7-201ENST00000258091 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.55■■□□□ 1.52
CCT7-201ENST00000258091 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.46■■□□□ 1.51
CCT7-201ENST00000258091 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.41■■□□□ 1.5
CCT7-201ENST00000258091 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.39■■□□□ 1.5
CCT7-201ENST00000258091 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCT7-201ENST00000258091 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.19■■□□□ 1.46
CCT7-201ENST00000258091 WIZO95785 1651 aa24.19■■□□□ 1.46
CCT7-201ENST00000258091 SMARCA4P51532 1647 aa24.13■■□□□ 1.45
CCT7-201ENST00000258091 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCT7-201ENST00000258091 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.436e-6■■□□□ 12.8
CCT7-201ENST00000258091 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.85■■□□□ 1.41
CCT7-201ENST00000258091 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCT7-201ENST00000258091 TRIM41Q8WV44 630 aa23.78■■□□□ 1.4
CCT7-201ENST00000258091 SMARCA2P51531 1590 aa23.77■■□□□ 1.4
CCT7-201ENST00000258091 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.75■■□□□ 1.39
CCT7-201ENST00000258091 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
CCT7-201ENST00000258091 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.6■■□□□ 1.37
CCT7-201ENST00000258091 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCT7-201ENST00000258091 ABCC8Q09428 1581 aa23.37■■□□□ 1.33
CCT7-201ENST00000258091 NCAPD3P42695 1498 aa23.35■■□□□ 1.33
CCT7-201ENST00000258091 HMGXB3Q12766 1538 aa23.35■■□□□ 1.33
CCT7-201ENST00000258091 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCT7-201ENST00000258091 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
CCT7-201ENST00000258091 EEA1Q15075 1411 aa23.16■■□□□ 1.3
CCT7-201ENST00000258091 SOGA1O94964 1423 aa23.07■■□□□ 1.28
CCT7-201ENST00000258091 SYNJ1O43426 1573 aa23.07■■□□□ 1.28
CCT7-201ENST00000258091 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.04■■□□□ 1.28
CCT7-201ENST00000258091 CFTRP13569 1480 aa22.97■■□□□ 1.27
CCT7-201ENST00000258091 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.97■■□□□ 1.27
CCT7-201ENST00000258091 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCT7-201ENST00000258091 TOP2BQ02880 1626 aa22.95■■□□□ 1.27
CCT7-201ENST00000258091 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.95■■□□□ 1.26
CCT7-201ENST00000258091 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.92■■□□□ 1.26
CCT7-201ENST00000258091 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.92■■□□□ 1.26
CCT7-201ENST00000258091 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.91■■□□□ 1.26
CCT7-201ENST00000258091 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.9■■□□□ 1.26
CCT7-201ENST00000258091 HRCP23327 699 aa22.84■■□□□ 1.25
CCT7-201ENST00000258091 GOLGA3Q08378 1498 aa22.84■■□□□ 1.25
CCT7-201ENST00000258091 PRDM2Q13029 1718 aa22.83■■□□□ 1.24
CCT7-201ENST00000258091 KIF21BO75037 1637 aa22.81■■□□□ 1.24
CCT7-201ENST00000258091 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.79■■□□□ 1.24
CCT7-201ENST00000258091 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.78■■□□□ 1.24
CCT7-201ENST00000258091 CUX1P39880 1505 aa22.78■■□□□ 1.24
CCT7-201ENST00000258091 CEP162Q5TB80 1403 aa22.77■■□□□ 1.24
CCT7-201ENST00000258091 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCT7-201ENST00000258091 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.58■■□□□ 1.2
CCT7-201ENST00000258091 PRXQ9BXM0 1461 aa22.57■■□□□ 1.2
CCT7-201ENST00000258091 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.57■■□□□ 1.2
CCT7-201ENST00000258091 KIF27Q86VH2 1401 aa22.57■■□□□ 1.2
CCT7-201ENST00000258091 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.57■■□□□ 1.2
CCT7-201ENST00000258091 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.51■■□□□ 1.19
CCT7-201ENST00000258091 CLIP1P30622 1438 aa22.48■■□□□ 1.19
CCT7-201ENST00000258091 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.44■■□□□ 1.18
CCT7-201ENST00000258091 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.43■■□□□ 1.18
CCT7-201ENST00000258091 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.4■■□□□ 1.18
CCT7-201ENST00000258091 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CCT7-201ENST00000258091 CUX2O14529 1486 aa22.38■■□□□ 1.17
CCT7-201ENST00000258091 NESP48681 1621 aa22.38■■□□□ 1.17
CCT7-201ENST00000258091 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.37■■□□□ 1.17
CCT7-201ENST00000258091 IGF1RP08069 1367 aa22.34■■□□□ 1.17
CCT7-201ENST00000258091 TOPBP1Q92547 1522 aa22.33■■□□□ 1.16
CCT7-201ENST00000258091 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCT7-201ENST00000258091 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.27■■□□□ 1.16
CCT7-201ENST00000258091 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.26■■□□□ 1.15
CCT7-201ENST00000258091 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCT7-201ENST00000258091 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.21■■□□□ 1.15
CCT7-201ENST00000258091 ARAP1Q96P48 1450 aa22.21■■□□□ 1.15
CCT7-201ENST00000258091 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCT7-201ENST00000258091 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.17■■□□□ 1.14
CCT7-201ENST00000258091 WDR97A6NE52 1622 aa22.13■■□□□ 1.13
CCT7-201ENST00000258091 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.12■■□□□ 1.13
CCT7-201ENST00000258091 APLP2Q06481 763 aa22.12■■□□□ 1.13
CCT7-201ENST00000258091 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCT7-201ENST00000258091 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.09■■□□□ 1.13
CCT7-201ENST00000258091 CUL7Q14999 1698 aa22.08■■□□□ 1.13
CCT7-201ENST00000258091 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CCT7-201ENST00000258091 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.03■■□□□ 1.12
CCT7-201ENST00000258091 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CCT7-201ENST00000258091 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.95■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.94■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 MAP3K1Q13233 1512 aa21.93■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT7-201ENST00000258091 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.89■■□□□ 1.09
CCT7-201ENST00000258091 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.87■■□□□ 1.09
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