RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.61■■■□□ 2.33
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C9orf16-202ENST00000486420 NACADO15069 1562 aa24.84■■□□□ 1.57
C9orf16-202ENST00000486420 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.74■■□□□ 1.55
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C9orf16-202ENST00000486420 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.59■■□□□ 1.53
C9orf16-202ENST00000486420 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.44■■□□□ 1.5
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C9orf16-202ENST00000486420 SCRIBQ14160 1630 aa23.99■■□□□ 1.43
C9orf16-202ENST00000486420 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.94■■□□□ 1.42
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C9orf16-202ENST00000486420 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf16-202ENST00000486420 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf16-202ENST00000486420 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
C9orf16-202ENST00000486420 SMARCA4P51532 1647 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf16-202ENST00000486420 SMARCA2P51531 1590 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf16-202ENST00000486420 NCAPD3P42695 1498 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf16-202ENST00000486420 HMGXB3Q12766 1538 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf16-202ENST00000486420 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf16-202ENST00000486420 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf16-202ENST00000486420 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.72■■□□□ 1.23
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C9orf16-202ENST00000486420 ERCC6Q03468 1493 aa22.44■■□□□ 1.18
C9orf16-202ENST00000486420 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.39■■□□□ 1.18
C9orf16-202ENST00000486420 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
C9orf16-202ENST00000486420 CUX2O14529 1486 aa22.36■■□□□ 1.17
C9orf16-202ENST00000486420 NESP48681 1621 aa22.36■■□□□ 1.17
C9orf16-202ENST00000486420 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
C9orf16-202ENST00000486420 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.22■■□□□ 1.15
C9orf16-202ENST00000486420 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.17■■□□□ 1.14
C9orf16-202ENST00000486420 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.14■■□□□ 1.14
C9orf16-202ENST00000486420 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
C9orf16-202ENST00000486420 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf16-202ENST00000486420 CFTRP13569 1480 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf16-202ENST00000486420 PRDM2Q13029 1718 aa22■■□□□ 1.11
C9orf16-202ENST00000486420 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf16-202ENST00000486420 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf16-202ENST00000486420 WDR62O43379 1518 aa21.96■■□□□ 1.11
C9orf16-202ENST00000486420 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.93■■□□□ 1.1
C9orf16-202ENST00000486420 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.86■■□□□ 1.09
C9orf16-202ENST00000486420 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
C9orf16-202ENST00000486420 ABCC8Q09428 1581 aa21.7■■□□□ 1.06
C9orf16-202ENST00000486420 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.56■■□□□ 1.04
C9orf16-202ENST00000486420 TOPBP1Q92547 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
C9orf16-202ENST00000486420 IFT140Q96RY7 1462 aa21.51■■□□□ 1.03
C9orf16-202ENST00000486420 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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C9orf16-202ENST00000486420 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
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C9orf16-202ENST00000486420 WDR97A6NE52 1622 aa21.3■■□□□ 1
C9orf16-202ENST00000486420 TOP2BQ02880 1626 aa21.27■■□□□ 1
C9orf16-202ENST00000486420 SOGA1O94964 1423 aa21.27■■□□□ 1
C9orf16-202ENST00000486420 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.26■□□□□ 0.99
C9orf16-202ENST00000486420 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.26■□□□□ 0.99
C9orf16-202ENST00000486420 OSCARQ8IYS5 282 aa21.23■□□□□ 0.99
C9orf16-202ENST00000486420 CHD1O14646 1710 aa21.2■□□□□ 0.98
C9orf16-202ENST00000486420 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.2■□□□□ 0.98
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C9orf16-202ENST00000486420 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
C9orf16-202ENST00000486420 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.07■□□□□ 0.96
C9orf16-202ENST00000486420 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
C9orf16-202ENST00000486420 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.06■□□□□ 0.96
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C9orf16-202ENST00000486420 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.06■□□□□ 0.96
C9orf16-202ENST00000486420 GRIN2BQ13224 1484 aa21.06■□□□□ 0.96
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C9orf16-202ENST00000486420 SYNJ2O15056 1496 aa20.96■□□□□ 0.95
C9orf16-202ENST00000486420 KIF27Q86VH2 1401 aa20.95■□□□□ 0.95
C9orf16-202ENST00000486420 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.94■□□□□ 0.94
C9orf16-202ENST00000486420 FBLN2P98095 1184 aa20.93■□□□□ 0.94
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C9orf16-202ENST00000486420 ADAMTS12P58397 1594 aa20.88■□□□□ 0.93
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C9orf16-202ENST00000486420 CUL7Q14999 1698 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf16-202ENST00000486420 EEA1Q15075 1411 aa20.76■□□□□ 0.91
C9orf16-202ENST00000486420 IGF1RP08069 1367 aa20.73■□□□□ 0.91
C9orf16-202ENST00000486420 CEP170Q5SW79 1584 aa20.71■□□□□ 0.91
C9orf16-202ENST00000486420 NUP160Q12769 1436 aa20.7■□□□□ 0.9
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C9orf16-202ENST00000486420 SHROOM2Q13796 1616 aa20.65■□□□□ 0.9
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