RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492588.1

C9orf16-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-204ENST00000492588 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.28■■■■■ 4.2
C9orf16-204ENST00000492588 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.41■■■■□ 3.42
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C9orf16-204ENST00000492588 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
C9orf16-204ENST00000492588 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.23■■■■□ 3.07
C9orf16-204ENST00000492588 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.07■■■■□ 3.04
C9orf16-204ENST00000492588 NACADO15069 1562 aa33.97■■■■□ 3.03
C9orf16-204ENST00000492588 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.9■■■■□ 3.02
C9orf16-204ENST00000492588 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.79■■■■□ 3
C9orf16-204ENST00000492588 SCRIBQ14160 1630 aa33.24■■■□□ 2.91
C9orf16-204ENST00000492588 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.2■■■□□ 2.9
C9orf16-204ENST00000492588 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33■■■□□ 2.87
C9orf16-204ENST00000492588 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.85■■■□□ 2.85
C9orf16-204ENST00000492588 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.52■■■□□ 2.8
C9orf16-204ENST00000492588 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.08■■■□□ 2.73
C9orf16-204ENST00000492588 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
C9orf16-204ENST00000492588 SMARCA4P51532 1647 aa31.9■■■□□ 2.7
C9orf16-204ENST00000492588 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
C9orf16-204ENST00000492588 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.85■■■□□ 2.69
C9orf16-204ENST00000492588 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
C9orf16-204ENST00000492588 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.61■■■□□ 2.65
C9orf16-204ENST00000492588 WIZO95785 1651 aa31.57■■■□□ 2.64
C9orf16-204ENST00000492588 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.52■■■□□ 2.64
C9orf16-204ENST00000492588 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.47■■■□□ 2.63
C9orf16-204ENST00000492588 SMARCA2P51531 1590 aa31.46■■■□□ 2.63
C9orf16-204ENST00000492588 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
C9orf16-204ENST00000492588 NCAPD3P42695 1498 aa31.32■■■□□ 2.6
C9orf16-204ENST00000492588 HMGXB3Q12766 1538 aa31.3■■■□□ 2.6
C9orf16-204ENST00000492588 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
C9orf16-204ENST00000492588 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
C9orf16-204ENST00000492588 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.14■■■□□ 2.58
C9orf16-204ENST00000492588 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.85■■■□□ 2.53
C9orf16-204ENST00000492588 CFTRP13569 1480 aa30.46■■■□□ 2.47
C9orf16-204ENST00000492588 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.41■■■□□ 2.46
C9orf16-204ENST00000492588 PRDM2Q13029 1718 aa30.4■■■□□ 2.46
C9orf16-204ENST00000492588 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.38■■■□□ 2.45
C9orf16-204ENST00000492588 NESP48681 1621 aa30.35■■■□□ 2.45
C9orf16-204ENST00000492588 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf16-204ENST00000492588 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf16-204ENST00000492588 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf16-204ENST00000492588 ABCC8Q09428 1581 aa30.01■■■□□ 2.4
C9orf16-204ENST00000492588 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.97■■■□□ 2.39
C9orf16-204ENST00000492588 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
C9orf16-204ENST00000492588 SYNJ1O43426 1573 aa29.86■■■□□ 2.37
C9orf16-204ENST00000492588 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.84■■■□□ 2.37
C9orf16-204ENST00000492588 CUX1P39880 1505 aa29.83■■■□□ 2.37
C9orf16-204ENST00000492588 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 ERCC6Q03468 1493 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 TOP2BQ02880 1626 aa29.8■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.78■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.77■■■□□ 2.36
C9orf16-204ENST00000492588 TOPBP1Q92547 1522 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf16-204ENST00000492588 WDR62O43379 1518 aa29.71■■■□□ 2.35
C9orf16-204ENST00000492588 TRIM41Q8WV44 630 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf16-204ENST00000492588 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf16-204ENST00000492588 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
C9orf16-204ENST00000492588 CUX2O14529 1486 aa29.43■■■□□ 2.3
C9orf16-204ENST00000492588 WDR97A6NE52 1622 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf16-204ENST00000492588 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
C9orf16-204ENST00000492588 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.37■■■□□ 2.29
C9orf16-204ENST00000492588 SOGA1O94964 1423 aa29.33■■■□□ 2.29
C9orf16-204ENST00000492588 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.33■■■□□ 2.29
C9orf16-204ENST00000492588 IFT140Q96RY7 1462 aa29.3■■■□□ 2.28
C9orf16-204ENST00000492588 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.22■■■□□ 2.27
C9orf16-204ENST00000492588 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.22■■■□□ 2.27
C9orf16-204ENST00000492588 KIF27Q86VH2 1401 aa29.15■■■□□ 2.26
C9orf16-204ENST00000492588 EEA1Q15075 1411 aa29.15■■■□□ 2.26
C9orf16-204ENST00000492588 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
C9orf16-204ENST00000492588 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
C9orf16-204ENST00000492588 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
C9orf16-204ENST00000492588 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf16-204ENST00000492588 PBRM1Q86U86 1689 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf16-204ENST00000492588 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.244e-9■■■■■ 33.2
C9orf16-204ENST00000492588 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.99■■■□□ 2.23
C9orf16-204ENST00000492588 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
C9orf16-204ENST00000492588 IGF1RP08069 1367 aa28.95■■■□□ 2.23
C9orf16-204ENST00000492588 GRIN2BQ13224 1484 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf16-204ENST00000492588 CUL7Q14999 1698 aa28.91■■■□□ 2.22
C9orf16-204ENST00000492588 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.91■■■□□ 2.22
C9orf16-204ENST00000492588 KIF21BO75037 1637 aa28.88■■■□□ 2.21
C9orf16-204ENST00000492588 PRXQ9BXM0 1461 aa28.88■■■□□ 2.21
C9orf16-204ENST00000492588 ADAMTS12P58397 1594 aa28.85■■■□□ 2.21
C9orf16-204ENST00000492588 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.82■■■□□ 2.2
C9orf16-204ENST00000492588 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
C9orf16-204ENST00000492588 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.77■■■□□ 2.2
C9orf16-204ENST00000492588 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.74■■■□□ 2.19
C9orf16-204ENST00000492588 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.74■■■□□ 2.19
C9orf16-204ENST00000492588 GOLGA3Q08378 1498 aa28.7■■■□□ 2.18
C9orf16-204ENST00000492588 SYNJ2O15056 1496 aa28.67■■■□□ 2.18
C9orf16-204ENST00000492588 GRIN2AQ12879 1464 aa28.61■■■□□ 2.17
C9orf16-204ENST00000492588 CHD1O14646 1710 aa28.6■■■□□ 2.17
C9orf16-204ENST00000492588 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.58■■■□□ 2.17
C9orf16-204ENST00000492588 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.52■■■□□ 2.16
C9orf16-204ENST00000492588 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.5■■■□□ 2.15
C9orf16-204ENST00000492588 CEP170Q5SW79 1584 aa28.47■■■□□ 2.15
C9orf16-204ENST00000492588 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.46■■■□□ 2.15
C9orf16-204ENST00000492588 NUP160Q12769 1436 aa28.46■■■□□ 2.15
C9orf16-204ENST00000492588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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