Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 NFKB2-202ENST00000336486 851 ntTSL 325.42■■□□□ 1.663e-10■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 NFKB2-205ENST00000467116 1634 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-10■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-10■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 PKN1-209ENST00000587215 363 ntTSL 320.02■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.473e-10■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.13e-10■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 EXOSC10-210ENST00000490565 421 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 MAGED2-208ENST00000463787 662 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 SZT2-205ENST00000470139 4098 ntTSL 211.02□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 30.7
DDX24Q9GZR7 CRYZL1-212ENST00000431177 607 ntTSL 39.49□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 DHX35-202ENST00000373323 2347 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 DHX35-206ENST00000484417 3318 ntTSL 210.46□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)13.79□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PKD1-237ENST00000569983 722 ntTSL 524.44■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PKD1-214ENST00000483024 465 ntTSL 520.85■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-220ENST00000627232 1530 ntTSL 526.3■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-203ENST00000593946 1723 ntTSL 1 (best)25.06■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 PNKP-204ENST00000594661 2111 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 AC005726.2-203ENST00000584196 2103 ntTSL 222.97■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 SGK494-212ENST00000581199 866 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 SGK494-201ENST00000301037 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 SGK494-206ENST00000526073 571 ntTSL 413.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 NAPRT-201ENST00000340490 1774 ntTSL 1 (best)29.74■■■□□ 2.352e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 NAPRT-207ENST00000464332 1212 ntTSL 222.56■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 ABCA7-206ENST00000525073 1918 ntTSL 225.16■■□□□ 1.625e-9■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 ATP6V0A2-202ENST00000504192 2525 ntTSL 514.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 ATP6V0A2-208ENST00000545059 4232 ntTSL 58.29□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 RNF213-215ENST00000573038 699 ntTSL 316.09■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 LCAT-207ENST00000575277 573 ntTSL 221.06■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 ATG4D-211ENST00000589753 931 ntTSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 LCAT-202ENST00000570369 348 ntTSL 214.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 30.6
DDX24Q9GZR7 ACAP3-209ENST00000476572 819 ntTSL 519.21■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 30.5
DDX24Q9GZR7 DOT1L-209ENST00000608122 576 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 30.5
DDX24Q9GZR7 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)21.55■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 30.5
DDX24Q9GZR7 PHKA2-204ENST00000469645 728 ntTSL 521.45■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 30.5
DDX24Q9GZR7 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt30.04■■■□□ 2.44e-34■■■■■ 30.5
DDX24Q9GZR7 BAP1-205ENST00000470173 578 ntTSL 311.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 FCHO1-227ENST00000598960 534 ntTSL 417.02■□□□□ 0.323e-16■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 FCHO1-213ENST00000596462 565 ntTSL 516.06■□□□□ 0.163e-16■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 FCHO1-223ENST00000598067 543 ntTSL 515.8■□□□□ 0.123e-16■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 FCHO1-202ENST00000593385 573 ntTSL 515.45■□□□□ 0.063e-16■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 FCHO1-204ENST00000593870 567 ntTSL 415.11■□□□□ 0.013e-16■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 C14orf159-235ENST00000557303 779 ntTSL 513.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 C14orf159-224ENST00000522816 827 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 EPHX2-211ENST00000523326 557 ntTSL 221.41■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 CBS-206ENST00000441030 819 ntTSL 523.08■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 CBS-212ENST00000470912 894 ntTSL 320.14■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 UQCC1-219ENST00000491125 990 ntTSL 519.2■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 UQCC1-218ENST00000491040 1017 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 ABCB6-209ENST00000492543 806 ntTSL 521.39■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 BMP1-208ENST00000518656 1059 ntTSL 1 (best)23.91■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-209ENST00000529476 581 ntTSL 316.96■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-205ENST00000473969 1092 ntTSL 516.69■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-206ENST00000491629 933 ntTSL 215.86■□□□□ 0.134e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-207ENST00000496363 990 ntTSL 215.71■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-211ENST00000534633 610 ntTSL 515.12■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.324e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 USF1-210ENST00000531842 720 ntTSL 510.71□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 INTS4-201ENST00000433818 3459 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 30.4
DDX24Q9GZR7 SHC1-206ENST00000412170 692 ntTSL 528.6■■■□□ 2.171e-6■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 221.88■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 RUBCN-204ENST00000415452 2665 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 RUBCN-203ENST00000413360 3801 ntTSL 510.72□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 BRAT1-206ENST00000493232 5360 ntTSL 219.52■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 BRAT1-204ENST00000469750 5226 ntTSL 218.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 30.3
DDX24Q9GZR7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 30.3
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