Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4R4

NCOR1P1, Putative nuclear receptor corepressor 1-like protein NCOR1P1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR1P1Q9H4R4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOR1P1Q9H4R4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCOR1P1Q9H4R4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOR1P1Q9H4R4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCOR1P1Q9H4R4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOR1P1Q9H4R4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOR1P1Q9H4R4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCOR1P1Q9H4R4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCOR1P1Q9H4R4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOR1P1Q9H4R4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCOR1P1Q9H4R4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOR1P1Q9H4R4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOR1P1Q9H4R4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOR1P1Q9H4R4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOR1P1Q9H4R4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms