RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400521.6

TXNRD2-204, Transcript of thioredoxin reductase 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TXNRD2, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2-204ENST00000400521 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.04■■■■■ 6.72
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TXNRD2-204ENST00000400521 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
TXNRD2-204ENST00000400521 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
TXNRD2-204ENST00000400521 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.02■■■■■ 5.12
TXNRD2-204ENST00000400521 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.71■■■■■ 5.07
TXNRD2-204ENST00000400521 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.22■■■■■ 4.99
TXNRD2-204ENST00000400521 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.1■■■■■ 4.97
TXNRD2-204ENST00000400521 ABCC9O60706 1549 aa45.68■■■■■ 4.9
TXNRD2-204ENST00000400521 SCRIBQ14160 1630 aa45.37■■■■■ 4.85
TXNRD2-204ENST00000400521 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
TXNRD2-204ENST00000400521 HRCP23327 699 aa44.95■■■■■ 4.79
TXNRD2-204ENST00000400521 NACADO15069 1562 aa44.92■■■■■ 4.78
TXNRD2-204ENST00000400521 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.74■■■■■ 4.75
TXNRD2-204ENST00000400521 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.69■■■■■ 4.74
TXNRD2-204ENST00000400521 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.65■■■■■ 4.74
TXNRD2-204ENST00000400521 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.31■■■■■ 4.68
TXNRD2-204ENST00000400521 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.25■■■■■ 4.67
TXNRD2-204ENST00000400521 TRIM41Q8WV44 630 aa44.21■■■■■ 4.67
TXNRD2-204ENST00000400521 WIZO95785 1651 aa44.06■■■■■ 4.64
TXNRD2-204ENST00000400521 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
TXNRD2-204ENST00000400521 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
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TXNRD2-204ENST00000400521 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
TXNRD2-204ENST00000400521 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
TXNRD2-204ENST00000400521 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.52■■■■■ 4.56
TXNRD2-204ENST00000400521 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
TXNRD2-204ENST00000400521 SMARCA4P51532 1647 aa43.49■■■■■ 4.55
TXNRD2-204ENST00000400521 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
TXNRD2-204ENST00000400521 SMARCA2P51531 1590 aa43.22■■■■■ 4.51
TXNRD2-204ENST00000400521 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.16■■■■■ 4.5
TXNRD2-204ENST00000400521 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.1■■■■■ 4.49
TXNRD2-204ENST00000400521 ABCC8Q09428 1581 aa43.01■■■■■ 4.48
TXNRD2-204ENST00000400521 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.88■■■■■ 4.45
TXNRD2-204ENST00000400521 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.76■■■■■ 4.44
TXNRD2-204ENST00000400521 EEA1Q15075 1411 aa42.66■■■■■ 4.42
TXNRD2-204ENST00000400521 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.41
TXNRD2-204ENST00000400521 SOGA1O94964 1423 aa42.56■■■■■ 4.4
TXNRD2-204ENST00000400521 CEP162Q5TB80 1403 aa42.5■■■■■ 4.39
TXNRD2-204ENST00000400521 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.49■■■■■ 4.397e-7■■■■□ 25.6
TXNRD2-204ENST00000400521 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.49■■■■■ 4.39
TXNRD2-204ENST00000400521 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.33■■■■■ 4.37
TXNRD2-204ENST00000400521 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.32■■■■■ 4.36
TXNRD2-204ENST00000400521 GOLGA3Q08378 1498 aa42.28■■■■■ 4.36
TXNRD2-204ENST00000400521 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.25■■■■■ 4.35
TXNRD2-204ENST00000400521 SYNJ1O43426 1573 aa42.19■■■■■ 4.34
TXNRD2-204ENST00000400521 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
TXNRD2-204ENST00000400521 KIF21BO75037 1637 aa42.11■■■■■ 4.33
TXNRD2-204ENST00000400521 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
TXNRD2-204ENST00000400521 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
TXNRD2-204ENST00000400521 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
TXNRD2-204ENST00000400521 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.04■■■■■ 4.32
TXNRD2-204ENST00000400521 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
TXNRD2-204ENST00000400521 TOP2BQ02880 1626 aa41.77■■■■■ 4.28
TXNRD2-204ENST00000400521 CLIP1P30622 1438 aa41.7■■■■■ 4.27
TXNRD2-204ENST00000400521 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.69■■■■■ 4.26
TXNRD2-204ENST00000400521 HMGXB3Q12766 1538 aa41.6■■■■■ 4.25
TXNRD2-204ENST00000400521 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.59■■■■■ 4.25
TXNRD2-204ENST00000400521 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.58■■■■■ 4.25
TXNRD2-204ENST00000400521 NCAPD3P42695 1498 aa41.47■■■■■ 4.23
TXNRD2-204ENST00000400521 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.42■■■■■ 4.22
TXNRD2-204ENST00000400521 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
TXNRD2-204ENST00000400521 PRXQ9BXM0 1461 aa41.29■■■■■ 4.2
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TXNRD2-204ENST00000400521 CUX1P39880 1505 aa41.24■■■■■ 4.19
TXNRD2-204ENST00000400521 APLP2Q06481 763 aa41.23■■■■■ 4.19
TXNRD2-204ENST00000400521 CFTRP13569 1480 aa41.14■■■■■ 4.18
TXNRD2-204ENST00000400521 PRDM2Q13029 1718 aa41.11■■■■■ 4.17
TXNRD2-204ENST00000400521 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
TXNRD2-204ENST00000400521 ARAP1Q96P48 1450 aa41.08■■■■■ 4.17
TXNRD2-204ENST00000400521 KIF27Q86VH2 1401 aa41.06■■■■■ 4.16
TXNRD2-204ENST00000400521 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
TXNRD2-204ENST00000400521 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
TXNRD2-204ENST00000400521 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
TXNRD2-204ENST00000400521 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
TXNRD2-204ENST00000400521 NEUROD1Q13562 356 aa40.86■■■■■ 4.13
TXNRD2-204ENST00000400521 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
TXNRD2-204ENST00000400521 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.69■■■■■ 4.1
TXNRD2-204ENST00000400521 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.67■■■■■ 4.1
TXNRD2-204ENST00000400521 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TXNRD2-204ENST00000400521 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
TXNRD2-204ENST00000400521 CUX2O14529 1486 aa40.59■■■■■ 4.09
TXNRD2-204ENST00000400521 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.59■■■■■ 4.09
TXNRD2-204ENST00000400521 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
TXNRD2-204ENST00000400521 IGF1RP08069 1367 aa40.51■■■■■ 4.08
TXNRD2-204ENST00000400521 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.48■■■■■ 4.07
TXNRD2-204ENST00000400521 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.45■■■■■ 4.07
TXNRD2-204ENST00000400521 MAP3K1Q13233 1512 aa40.42■■■■■ 4.06
TXNRD2-204ENST00000400521 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.39■■■■■ 4.06
TXNRD2-204ENST00000400521 TIAM1Q13009 1591 aa40.36■■■■■ 4.05
TXNRD2-204ENST00000400521 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.35■■■■■ 4.05
TXNRD2-204ENST00000400521 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.34■■■■■ 4.05
TXNRD2-204ENST00000400521 MIER1Q8N108 512 aa40.33■■■■■ 4.05
TXNRD2-204ENST00000400521 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.23■■■■■ 4.03
TXNRD2-204ENST00000400521 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.2■■■■■ 4.03
TXNRD2-204ENST00000400521 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.18■■■■■ 4.02
TXNRD2-204ENST00000400521 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
TXNRD2-204ENST00000400521 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.13■■■■■ 4.02
TXNRD2-204ENST00000400521 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.13■■■■■ 4.02
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