Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ67

GRWD1, Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRWD1Q9BQ67 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.253e-7■■■■■ 32.5
GRWD1Q9BQ67 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 522.09■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 32.5
GRWD1Q9BQ67 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 221.86■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 32.5
GRWD1Q9BQ67 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 32.5
GRWD1Q9BQ67 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 221.47■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 32.5
GRWD1Q9BQ67 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 220.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 32.5
GRWD1Q9BQ67 SORBS3-217ENST00000523402 889 ntTSL 324.26■■□□□ 1.475e-8■■■■■ 32.4
GRWD1Q9BQ67 TTLL4-213ENST00000461181 590 ntTSL 412.61□□□□□ -0.391e-9■■■■■ 32.4
GRWD1Q9BQ67 TTLL4-221ENST00000494428 829 ntTSL 312.26□□□□□ -0.451e-9■■■■■ 32.4
GRWD1Q9BQ67 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 511.12□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 32.4
GRWD1Q9BQ67 TRIM26-269ENST00000480999 3114 ntTSL 215.4■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 32.3
GRWD1Q9BQ67 XPA-203ENST00000485042 706 ntTSL 312.2□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 32.3
GRWD1Q9BQ67 PPM1G-203ENST00000484925 836 ntTSL 226.38■■□□□ 1.812e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 EFTUD2-212ENST00000589211 584 ntTSL 415.79■□□□□ 0.123e-13■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-209ENST00000562311 777 ntTSL 539.49■■■■□ 3.911e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-208ENST00000561524 577 ntTSL 425.64■■□□□ 1.71e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-232ENST00000569112 564 ntTSL 424.31■■□□□ 1.481e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-210ENST00000562503 737 ntTSL 424.24■■□□□ 1.471e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-226ENST00000566648 651 ntTSL 323.57■■□□□ 1.361e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-230ENST00000567204 516 ntTSL 421.7■■□□□ 1.061e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-212ENST00000562984 551 ntTSL 421.23■□□□□ 0.991e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-233ENST00000569222 443 ntTSL 320.42■□□□□ 0.861e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-234ENST00000569619 698 ntTSL 318.26■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-222ENST00000565481 788 ntTSL 518.01■□□□□ 0.471e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-220ENST00000565351 297 ntTSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 316.14■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 32.1
GRWD1Q9BQ67 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.414e-10■■■■■ 32
GRWD1Q9BQ67 SLC28A1-202ENST00000338602 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-10■■■■■ 32
GRWD1Q9BQ67 SLC28A1-204ENST00000538177 2155 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 32
GRWD1Q9BQ67 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-10■■■■■ 32
GRWD1Q9BQ67 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 510.83□□□□□ -0.688e-8■■■■■ 32
GRWD1Q9BQ67 ZNF638-225ENST00000494241 703 ntTSL 316.16■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 32
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-207ENST00000478181 793 ntTSL 312.5□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 31.7
GRWD1Q9BQ67 HSP90AA1-210ENST00000560130 488 ntTSL 214.73□□□□□ -0.051e-17■■■■■ 31.7
GRWD1Q9BQ67 CACNB4-226ENST00000636496 430 ntTSL 518.81■□□□□ 0.65e-10■■■■■ 31.7
GRWD1Q9BQ67 CACNB4-252ENST00000637479 4858 ntTSL 512.05□□□□□ -0.485e-10■■■■■ 31.7
GRWD1Q9BQ67 CACNB4-272ENST00000638083 6849 nt10.73□□□□□ -0.695e-10■■■■■ 31.7
GRWD1Q9BQ67 CACNB4-215ENST00000635835 1807 ntTSL 58.03□□□□□ -1.125e-10■■■■■ 31.7
GRWD1Q9BQ67 TPM3-220ENST00000509601 543 ntTSL 427.73■■■□□ 2.034e-19■■■■■ 31.6
GRWD1Q9BQ67 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 220.49■□□□□ 0.873e-9■■■■■ 31.6
GRWD1Q9BQ67 NOP2-216ENST00000542944 1080 ntTSL 519.64■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 31.5
GRWD1Q9BQ67 NOP2-215ENST00000542919 894 ntTSL 214.02□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 31.5
GRWD1Q9BQ67 RFC1-214ENST00000512726 752 ntTSL 217.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 31.4
GRWD1Q9BQ67 RFC1-215ENST00000512881 537 ntTSL 317.34■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 31.4
GRWD1Q9BQ67 KAT8-203ENST00000537402 1345 ntTSL 1 (best)24.49■■□□□ 1.513e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 KAT8-204ENST00000538768 2500 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 ELMO2-213ENST00000469801 874 ntTSL 524.49■■□□□ 1.512e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 ELMO2-208ENST00000460474 749 ntTSL 524.49■■□□□ 1.512e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 ELMO2-218ENST00000497412 777 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 ELMO2-216ENST00000487583 653 ntTSL 511.85□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 ELMO2-210ENST00000462593 498 ntTSL 311.37□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 31.3
GRWD1Q9BQ67 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.465e-18■■■■■ 31.2
GRWD1Q9BQ67 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.935e-18■■■■■ 31.2
GRWD1Q9BQ67 COA4-202ENST00000537289 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.125e-18■■■■■ 31.2
GRWD1Q9BQ67 COA4-206ENST00000545127 922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.175e-18■■■■■ 31.2
GRWD1Q9BQ67 ITSN1-223ENST00000465143 614 ntTSL 313.82□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 31.2
GRWD1Q9BQ67 SPIN1-202ENST00000462844 599 ntTSL 232.41■■■□□ 2.789e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 SPIN1-203ENST00000469017 2082 ntTSL 230.03■■■□□ 2.49e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 SPIN1-206ENST00000485804 814 ntTSL 329.66■■■□□ 2.349e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 SPIN1-205ENST00000485565 706 ntTSL 327.8■■■□□ 2.049e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 BFAR-210ENST00000566520 1177 ntTSL 222.37■■□□□ 1.179e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 19e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 BFAR-202ENST00000562121 723 ntTSL 519.24■□□□□ 0.679e-10■■■■■ 31.1
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GRWD1Q9BQ67 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.619e-10■■■■■ 31.1
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GRWD1Q9BQ67 THYN1-201ENST00000341541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.339e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 THYN1-204ENST00000392595 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.339e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 THYN1-208ENST00000533975 1074 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.029e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 SPIN1-204ENST00000483785 659 ntTSL 511.64□□□□□ -0.559e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC9.35□□□□□ -0.919e-10■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.931e-11■■■■■ 31.1
GRWD1Q9BQ67 LIG1-212ENST00000596549 580 ntTSL 420.18■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 31
GRWD1Q9BQ67 LIG1-217ENST00000599165 570 ntTSL 418.74■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 31
GRWD1Q9BQ67 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.084e-9■■■■■ 31
GRWD1Q9BQ67 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 31
GRWD1Q9BQ67 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 30.9
GRWD1Q9BQ67 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-11■■■■■ 30.9
GRWD1Q9BQ67 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-11■■■■■ 30.9
GRWD1Q9BQ67 EDC4-213ENST00000577028 747 ntTSL 426.81■■□□□ 1.887e-10■■■■■ 30.9
GRWD1Q9BQ67 SLC25A16-204ENST00000491102 538 ntTSL 430.62■■■□□ 2.494e-12■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 SLC25A16-205ENST00000493963 1121 ntTSL 1 (best)30.02■■■□□ 2.44e-12■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 SLC25A16-201ENST00000265870 2295 ntTSL 214.14□□□□□ -0.154e-12■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-12■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 CKAP2-205ENST00000468284 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.48■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 CKAP2-206ENST00000480747 537 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 30.8
GRWD1Q9BQ67 NFIA-211ENST00000482020 552 ntTSL 312.73□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 30.7
GRWD1Q9BQ67 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 30.7
GRWD1Q9BQ67 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 30.7
GRWD1Q9BQ67 CAPN2-209ENST00000487223 2991 ntTSL 29.14□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 30.7
GRWD1Q9BQ67 CAPN2-206ENST00000474026 4130 ntTSL 26.42□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 30.7
GRWD1Q9BQ67 DAPK1-214ENST00000494010 696 ntTSL 39.44□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 30.6
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 30.6
GRWD1Q9BQ67 RWDD1-204ENST00000487832 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-10■■■■■ 30.6
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