RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562503.5

KIFC3-210, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 4

Gene KIFC3, Length 737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-210ENST00000562503 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.13■■■■□ 3.85
KIFC3-210ENST00000562503 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.06■■■■□ 3.2
KIFC3-210ENST00000562503 ABCC9O60706 1549 aa34.77■■■■□ 3.16
KIFC3-210ENST00000562503 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.26■■■□□ 2.91
KIFC3-210ENST00000562503 NACADO15069 1562 aa33.1■■■□□ 2.89
KIFC3-210ENST00000562503 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.79■■■□□ 2.84
KIFC3-210ENST00000562503 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.74■■■□□ 2.83
KIFC3-210ENST00000562503 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
KIFC3-210ENST00000562503 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.48■■■□□ 2.79
KIFC3-210ENST00000562503 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.47■■■□□ 2.79
KIFC3-210ENST00000562503 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.41■■■□□ 2.78
KIFC3-210ENST00000562503 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.77
KIFC3-210ENST00000562503 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.3■■■□□ 2.76
KIFC3-210ENST00000562503 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.97■■■□□ 2.71
KIFC3-210ENST00000562503 SCRIBQ14160 1630 aa31.86■■■□□ 2.69
KIFC3-210ENST00000562503 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
KIFC3-210ENST00000562503 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.47■■■□□ 2.63
KIFC3-210ENST00000562503 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.34■■■□□ 2.61
KIFC3-210ENST00000562503 NCAPD3P42695 1498 aa30.57■■■□□ 2.48
KIFC3-210ENST00000562503 SMARCA4P51532 1647 aa30.47■■■□□ 2.47
KIFC3-210ENST00000562503 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.47■■■□□ 2.47
KIFC3-210ENST00000562503 SMARCA2P51531 1590 aa30.4■■■□□ 2.46
KIFC3-210ENST00000562503 HMGXB3Q12766 1538 aa30.37■■■□□ 2.45
KIFC3-210ENST00000562503 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
KIFC3-210ENST00000562503 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.25■■■□□ 2.43
KIFC3-210ENST00000562503 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
KIFC3-210ENST00000562503 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.12■■■□□ 2.41
KIFC3-210ENST00000562503 ERCC6Q03468 1493 aa30■■■□□ 2.39
KIFC3-210ENST00000562503 CUX2O14529 1486 aa29.99■■■□□ 2.39
KIFC3-210ENST00000562503 NESP48681 1621 aa29.93■■■□□ 2.38
KIFC3-210ENST00000562503 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.83■■■□□ 2.37
KIFC3-210ENST00000562503 WIZO95785 1651 aa29.74■■■□□ 2.35
KIFC3-210ENST00000562503 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.71■■■□□ 2.35
KIFC3-210ENST00000562503 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
KIFC3-210ENST00000562503 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
KIFC3-210ENST00000562503 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.61■■■□□ 2.33
KIFC3-210ENST00000562503 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
KIFC3-210ENST00000562503 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.56■■■□□ 2.32
KIFC3-210ENST00000562503 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
KIFC3-210ENST00000562503 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.36■■■□□ 2.29
KIFC3-210ENST00000562503 CFTRP13569 1480 aa29.34■■■□□ 2.29
KIFC3-210ENST00000562503 WDR62O43379 1518 aa29.32■■■□□ 2.28
KIFC3-210ENST00000562503 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.27■■■□□ 2.28
KIFC3-210ENST00000562503 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.25■■■□□ 2.27
KIFC3-210ENST00000562503 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.07■■■□□ 2.24
KIFC3-210ENST00000562503 PRDM2Q13029 1718 aa29.04■■■□□ 2.24
KIFC3-210ENST00000562503 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
KIFC3-210ENST00000562503 TOPBP1Q92547 1522 aa28.73■■■□□ 2.19
KIFC3-210ENST00000562503 ABCC8Q09428 1581 aa28.71■■■□□ 2.19
KIFC3-210ENST00000562503 IFT140Q96RY7 1462 aa28.71■■■□□ 2.19
KIFC3-210ENST00000562503 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.65■■■□□ 2.18
KIFC3-210ENST00000562503 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
KIFC3-210ENST00000562503 OSCARQ8IYS5 282 aa28.57■■■□□ 2.16
KIFC3-210ENST00000562503 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
KIFC3-210ENST00000562503 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
KIFC3-210ENST00000562503 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
KIFC3-210ENST00000562503 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
KIFC3-210ENST00000562503 TRIM41Q8WV44 630 aa28.36■■■□□ 2.13
KIFC3-210ENST00000562503 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.133e-9■■■■■ 42.8
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KIFC3-210ENST00000562503 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.3■■■□□ 2.12
KIFC3-210ENST00000562503 SOGA1O94964 1423 aa28.29■■■□□ 2.12
KIFC3-210ENST00000562503 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.28■■■□□ 2.12
KIFC3-210ENST00000562503 WDR97A6NE52 1622 aa28.27■■■□□ 2.12
KIFC3-210ENST00000562503 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.21■■■□□ 2.11
KIFC3-210ENST00000562503 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.21■■■□□ 2.11
KIFC3-210ENST00000562503 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.21■■■□□ 2.11
KIFC3-210ENST00000562503 CHD1O14646 1710 aa28.19■■■□□ 2.1
KIFC3-210ENST00000562503 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
KIFC3-210ENST00000562503 ARHGEF11O15085 1522 aa28.15■■■□□ 2.1
KIFC3-210ENST00000562503 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.08■■■□□ 2.09
KIFC3-210ENST00000562503 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
KIFC3-210ENST00000562503 GRIN2BQ13224 1484 aa28.06■■■□□ 2.08
KIFC3-210ENST00000562503 FBLN2P98095 1184 aa28.03■■■□□ 2.08
KIFC3-210ENST00000562503 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.02■■■□□ 2.08
KIFC3-210ENST00000562503 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.97■■■□□ 2.07
KIFC3-210ENST00000562503 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.96■■■□□ 2.07
KIFC3-210ENST00000562503 SYNJ2O15056 1496 aa27.95■■■□□ 2.07
KIFC3-210ENST00000562503 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.94■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 PBRM1Q86U86 1689 aa27.94■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.92■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 SYNJ1O43426 1573 aa27.91■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 TOP2BQ02880 1626 aa27.91■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
KIFC3-210ENST00000562503 ARAP1Q96P48 1450 aa27.89■■■□□ 2.05
KIFC3-210ENST00000562503 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.84■■■□□ 2.05
KIFC3-210ENST00000562503 ADAMTS12P58397 1594 aa27.72■■■□□ 2.03
KIFC3-210ENST00000562503 GRIN2AQ12879 1464 aa27.7■■■□□ 2.03
KIFC3-210ENST00000562503 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.67■■■□□ 2.02
KIFC3-210ENST00000562503 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.65■■■□□ 2.02
KIFC3-210ENST00000562503 NUP160Q12769 1436 aa27.64■■■□□ 2.02
KIFC3-210ENST00000562503 CEP170Q5SW79 1584 aa27.58■■■□□ 2.01
KIFC3-210ENST00000562503 SHROOM2Q13796 1616 aa27.49■■□□□ 1.99
KIFC3-210ENST00000562503 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.46■■□□□ 1.99
KIFC3-210ENST00000562503 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
KIFC3-210ENST00000562503 KIF27Q86VH2 1401 aa27.35■■□□□ 1.97
KIFC3-210ENST00000562503 IGF1RP08069 1367 aa27.33■■□□□ 1.97
KIFC3-210ENST00000562503 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.32■■□□□ 1.96
KIFC3-210ENST00000562503 CUL7Q14999 1698 aa27.28■■□□□ 1.96
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