RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569112.5

KIFC3-232, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 4

Gene KIFC3, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-232ENST00000569112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.34■■■■□ 3.89
KIFC3-232ENST00000569112 ABCC9O60706 1549 aa36.22■■■■□ 3.39
KIFC3-232ENST00000569112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.44■■■■□ 3.26
KIFC3-232ENST00000569112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.82■■■■□ 3.16
KIFC3-232ENST00000569112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.06■■■■□ 3.04
KIFC3-232ENST00000569112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.7■■■□□ 2.99
KIFC3-232ENST00000569112 NACADO15069 1562 aa33.69■■■□□ 2.98
KIFC3-232ENST00000569112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.45■■■□□ 2.95
KIFC3-232ENST00000569112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.42■■■□□ 2.94
KIFC3-232ENST00000569112 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.31■■■□□ 2.92
KIFC3-232ENST00000569112 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.04■■■□□ 2.88
KIFC3-232ENST00000569112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.66■■■□□ 2.82
KIFC3-232ENST00000569112 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.66■■■□□ 2.82
KIFC3-232ENST00000569112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.53■■■□□ 2.8
KIFC3-232ENST00000569112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
KIFC3-232ENST00000569112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
KIFC3-232ENST00000569112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.39■■■□□ 2.78
KIFC3-232ENST00000569112 SCRIBQ14160 1630 aa32.33■■■□□ 2.77
KIFC3-232ENST00000569112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.27■■■□□ 2.76
KIFC3-232ENST00000569112 CUX2O14529 1486 aa31.38■■■□□ 2.61
KIFC3-232ENST00000569112 NCAPD3P42695 1498 aa31.22■■■□□ 2.59
KIFC3-232ENST00000569112 ERCC6Q03468 1493 aa31.17■■■□□ 2.58
KIFC3-232ENST00000569112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.03■■■□□ 2.56
KIFC3-232ENST00000569112 NESP48681 1621 aa31.01■■■□□ 2.55
KIFC3-232ENST00000569112 HMGXB3Q12766 1538 aa30.83■■■□□ 2.53
KIFC3-232ENST00000569112 SMARCA4P51532 1647 aa30.79■■■□□ 2.52
KIFC3-232ENST00000569112 SMARCA2P51531 1590 aa30.78■■■□□ 2.52
KIFC3-232ENST00000569112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
KIFC3-232ENST00000569112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
KIFC3-232ENST00000569112 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.5■■■□□ 2.47
KIFC3-232ENST00000569112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.5■■■□□ 2.47
KIFC3-232ENST00000569112 TRIM41Q8WV44 630 aa30.49■■■□□ 2.47
KIFC3-232ENST00000569112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.48■■■□□ 2.47
KIFC3-232ENST00000569112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
KIFC3-232ENST00000569112 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.37■■■□□ 2.45
KIFC3-232ENST00000569112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.34■■■□□ 2.45
KIFC3-232ENST00000569112 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.22■■■□□ 2.43
KIFC3-232ENST00000569112 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.16■■■□□ 2.42
KIFC3-232ENST00000569112 WDR62O43379 1518 aa30.13■■■□□ 2.41
KIFC3-232ENST00000569112 WIZO95785 1651 aa29.94■■■□□ 2.38
KIFC3-232ENST00000569112 OSCARQ8IYS5 282 aa29.9■■■□□ 2.38
KIFC3-232ENST00000569112 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.87■■■□□ 2.37
KIFC3-232ENST00000569112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.84■■■□□ 2.37
KIFC3-232ENST00000569112 CFTRP13569 1480 aa29.74■■■□□ 2.35
KIFC3-232ENST00000569112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
KIFC3-232ENST00000569112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.6■■■□□ 2.33
KIFC3-232ENST00000569112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.6■■■□□ 2.33
KIFC3-232ENST00000569112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.6■■■□□ 2.33
KIFC3-232ENST00000569112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
KIFC3-232ENST00000569112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
KIFC3-232ENST00000569112 ARHGEF11O15085 1522 aa29.43■■■□□ 2.3
KIFC3-232ENST00000569112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
KIFC3-232ENST00000569112 IFT140Q96RY7 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
KIFC3-232ENST00000569112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.29■■■□□ 2.28
KIFC3-232ENST00000569112 PRDM2Q13029 1718 aa29.24■■■□□ 2.27
KIFC3-232ENST00000569112 TOPBP1Q92547 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
KIFC3-232ENST00000569112 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.2■■■□□ 2.26
KIFC3-232ENST00000569112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
KIFC3-232ENST00000569112 ARAP1Q96P48 1450 aa29.14■■■□□ 2.26
KIFC3-232ENST00000569112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.253e-9■■■■■ 42.8
KIFC3-232ENST00000569112 CHD1O14646 1710 aa29.08■■■□□ 2.25
KIFC3-232ENST00000569112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
KIFC3-232ENST00000569112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
KIFC3-232ENST00000569112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.01■■■□□ 2.23
KIFC3-232ENST00000569112 ABCC8Q09428 1581 aa29■■■□□ 2.23
KIFC3-232ENST00000569112 FBLN2P98095 1184 aa28.94■■■□□ 2.22
KIFC3-232ENST00000569112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
KIFC3-232ENST00000569112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.87■■■□□ 2.21
KIFC3-232ENST00000569112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
KIFC3-232ENST00000569112 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.78■■■□□ 2.2
KIFC3-232ENST00000569112 SOGA1O94964 1423 aa28.74■■■□□ 2.19
KIFC3-232ENST00000569112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.72■■■□□ 2.19
KIFC3-232ENST00000569112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
KIFC3-232ENST00000569112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.61■■■□□ 2.17
KIFC3-232ENST00000569112 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
KIFC3-232ENST00000569112 SYNJ1O43426 1573 aa28.57■■■□□ 2.16
KIFC3-232ENST00000569112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
KIFC3-232ENST00000569112 CUX1P39880 1505 aa28.53■■■□□ 2.16
KIFC3-232ENST00000569112 WDR97A6NE52 1622 aa28.53■■■□□ 2.16
KIFC3-232ENST00000569112 GRIN2BQ13224 1484 aa28.52■■■□□ 2.16
KIFC3-232ENST00000569112 SYNJ2O15056 1496 aa28.5■■■□□ 2.15
KIFC3-232ENST00000569112 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.48■■■□□ 2.15
KIFC3-232ENST00000569112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.39■■■□□ 2.14
KIFC3-232ENST00000569112 PBRM1Q86U86 1689 aa28.34■■■□□ 2.13
KIFC3-232ENST00000569112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.25■■■□□ 2.11
KIFC3-232ENST00000569112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.23■■■□□ 2.11
KIFC3-232ENST00000569112 GRIN2AQ12879 1464 aa28.18■■■□□ 2.1
KIFC3-232ENST00000569112 CEP170Q5SW79 1584 aa28.17■■■□□ 2.1
KIFC3-232ENST00000569112 NUP160Q12769 1436 aa28.15■■■□□ 2.1
KIFC3-232ENST00000569112 SHROOM2Q13796 1616 aa28.09■■■□□ 2.09
KIFC3-232ENST00000569112 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.08■■■□□ 2.09
KIFC3-232ENST00000569112 ADAMTS12P58397 1594 aa28.06■■■□□ 2.08
KIFC3-232ENST00000569112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.95■■■□□ 2.07
KIFC3-232ENST00000569112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
KIFC3-232ENST00000569112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
KIFC3-232ENST00000569112 JPH4Q96JJ6 628 aa27.87■■■□□ 2.05
KIFC3-232ENST00000569112 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.84■■■□□ 2.05
KIFC3-232ENST00000569112 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.84■■■□□ 2.05
KIFC3-232ENST00000569112 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.83■■■□□ 2.05
KIFC3-232ENST00000569112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.83■■■□□ 2.05
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