Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF5Q99942 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF5Q99942 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF5Q99942 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF5Q99942 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF5Q99942 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF5Q99942 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF5Q99942 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF5Q99942 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms