Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CDK5RAP2Q96SN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK5RAP2Q96SN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK5RAP2Q96SN8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK5RAP2Q96SN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK5RAP2Q96SN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK5RAP2Q96SN8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK5RAP2Q96SN8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK5RAP2Q96SN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK5RAP2Q96SN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK5RAP2Q96SN8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK5RAP2Q96SN8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK5RAP2Q96SN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK5RAP2Q96SN8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CDK5RAP2Q96SN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK5RAP2Q96SN8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK5RAP2Q96SN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK5RAP2Q96SN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDK5RAP2Q96SN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CDK5RAP2Q96SN8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDK5RAP2Q96SN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK5RAP2Q96SN8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDK5RAP2Q96SN8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDK5RAP2Q96SN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CDK5RAP2Q96SN8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK5RAP2Q96SN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK5RAP2Q96SN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms