Protein–RNA interactions for Protein: Q96P65

QRFPR, Pyroglutamylated RFamide peptide receptor, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QRFPRQ96P65 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
QRFPRQ96P65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
QRFPRQ96P65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
QRFPRQ96P65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
QRFPRQ96P65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
QRFPRQ96P65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
QRFPRQ96P65 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
QRFPRQ96P65 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
QRFPRQ96P65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
QRFPRQ96P65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
QRFPRQ96P65 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
QRFPRQ96P65 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
QRFPRQ96P65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
QRFPRQ96P65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
QRFPRQ96P65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
QRFPRQ96P65 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
QRFPRQ96P65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
QRFPRQ96P65 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
QRFPRQ96P65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
QRFPRQ96P65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
QRFPRQ96P65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
QRFPRQ96P65 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms