Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt16.42■□□□□ 0.221e-323■■■■■ 91.1
NOLC1Q14978 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.181e-323■■■■■ 90.7
NOLC1Q14978 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 24.07□□□□□ -1.768e-40■■■■■ 89.6
NOLC1Q14978 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 311.49□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 88.1
NOLC1Q14978 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 411.3□□□□□ -0.61e-323■■■■■ 88.1
NOLC1Q14978 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 48.76□□□□□ -1.011e-323■■■■■ 88.1
NOLC1Q14978 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 88.1
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NOLC1Q14978 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 88.1
NOLC1Q14978 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 325.54■■□□□ 1.683e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 221.36■■□□□ 1.013e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 518.66■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 512.94□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 511.27□□□□□ -0.611e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 510.72□□□□□ -0.693e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 37.57□□□□□ -1.21e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 35.81□□□□□ -1.483e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.543e-10■■■■■ 86.8
NOLC1Q14978 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.411e-323■■■■■ 86.5
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NOLC1Q14978 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.561e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.81e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.991e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.31□□□□□ -1.081e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 57.87□□□□□ -1.151e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.241e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.251e-19■■■■■ 85.7
NOLC1Q14978 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.095e-14■■■■■ 85.3
NOLC1Q14978 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.215e-14■■■■■ 85.3
NOLC1Q14978 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 49.72□□□□□ -0.855e-14■■■■■ 85.3
NOLC1Q14978 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 84.5
NOLC1Q14978 UBAP2-209ENST00000474372 1339 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 84.2
NOLC1Q14978 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 25.42□□□□□ -1.541e-111■■■■■ 84.1
NOLC1Q14978 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-45■■■■■ 83.7
NOLC1Q14978 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-45■■■■■ 83.7
NOLC1Q14978 WDYHV1-204ENST00000519199 949 ntTSL 210.94□□□□□ -0.662e-45■■■■■ 83.7
NOLC1Q14978 WDYHV1-207ENST00000523551 853 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-45■■■■■ 83.7
NOLC1Q14978 WDYHV1-202ENST00000517609 909 ntTSL 28.47□□□□□ -1.052e-45■■■■■ 83.7
NOLC1Q14978 WDYHV1-209ENST00000524254 764 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-45■■■■■ 83.7
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NOLC1Q14978 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.382e-45■■■■■ 83.7
NOLC1Q14978 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.321e-323■■■■■ 80.6
NOLC1Q14978 GNL3-209ENST00000484022 668 ntTSL 24.25□□□□□ -1.732e-68■■■■■ 80
NOLC1Q14978 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 519.77■□□□□ 0.761e-323■■■■■ 79.5
NOLC1Q14978 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.671e-323■■■■■ 79.5
NOLC1Q14978 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.951e-323■■■■■ 79.5
NOLC1Q14978 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.1□□□□□ -1.911e-323■■■■■ 79
NOLC1Q14978 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 79
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NOLC1Q14978 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 78.8
NOLC1Q14978 AP1G1-215ENST00000568327 1724 ntTSL 520.61■□□□□ 0.897e-86■■■■■ 78.2
NOLC1Q14978 AP1G1-208ENST00000565009 2494 ntTSL 515.93■□□□□ 0.147e-86■■■■■ 78.2
NOLC1Q14978 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.147e-86■■■■■ 78.2
NOLC1Q14978 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.657e-86■■■■■ 78.2
NOLC1Q14978 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.877e-86■■■■■ 78.2
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NOLC1Q14978 AP1G1-213ENST00000566179 562 ntTSL 53.94□□□□□ -1.787e-86■■■■■ 78.2
NOLC1Q14978 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.37e-86■■■■■ 78.2
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NOLC1Q14978 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 34.13□□□□□ -1.755e-19■■■■■ 77.4
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NOLC1Q14978 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 321.04■□□□□ 0.961e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 318.44■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.881e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-10■■■■■ 77.3
NOLC1Q14978 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.151e-323■■■■■ 77.1
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NOLC1Q14978 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.347e-29■■■■■ 76.1
NOLC1Q14978 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.68□□□□□ -1.667e-29■■■■■ 76.1
NOLC1Q14978 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 74.6
NOLC1Q14978 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 74.6
NOLC1Q14978 GNL3-211ENST00000496254 2118 ntTSL 56.67□□□□□ -1.343e-10■■■■■ 74.6
NOLC1Q14978 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 27.96□□□□□ -1.141e-48■■■■■ 74.3
NOLC1Q14978 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.71□□□□□ -1.181e-323■■■■■ 71.8
NOLC1Q14978 RABGGTB-214ENST00000497648 1319 ntTSL 29.79□□□□□ -0.844e-45■■■■■ 71.2
NOLC1Q14978 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 317.52■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 70.8
NOLC1Q14978 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-11■■■■■ 70.8
NOLC1Q14978 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.584e-11■■■■■ 70.8
NOLC1Q14978 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.764e-11■■■■■ 70.8
NOLC1Q14978 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.084e-11■■■■■ 70.8
NOLC1Q14978 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.494e-11■■■■■ 70.8
NOLC1Q14978 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-49■■■■■ 70.7
NOLC1Q14978 CHD3-208ENST00000470531 3744 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-49■■■■■ 70.7
NOLC1Q14978 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-49■■■■■ 70.7
NOLC1Q14978 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-49■■■■■ 70.7
NOLC1Q14978 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.078e-112■■■■■ 70
NOLC1Q14978 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.269e-17■■■■■ 67.4
NOLC1Q14978 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.39□□□□□ -0.757e-112■■■■■ 65.8
NOLC1Q14978 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 29.11□□□□□ -0.957e-112■■■■■ 65.8
NOLC1Q14978 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.88□□□□□ -0.997e-112■■■■■ 65.8
NOLC1Q14978 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.9□□□□□ -1.147e-112■■■■■ 65.8
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