RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTB-214ENST00000497648 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
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RABGGTB-214ENST00000497648 SLC4A2P04920 1241 aa16.77■□□□□ 0.28
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RABGGTB-214ENST00000497648 HOMEZQ8IX15 550 aa14.2□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
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RABGGTB-214ENST00000497648 CHADLQ6NUI6 762 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-214ENST00000497648 MIER1Q8N108 512 aa14.04□□□□□ -0.16
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