Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NAE1Q13564 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NAE1Q13564 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAE1Q13564 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAE1Q13564 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAE1Q13564 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NAE1Q13564 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAE1Q13564 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAE1Q13564 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAE1Q13564 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAE1Q13564 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAE1Q13564 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NAE1Q13564 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NAE1Q13564 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NAE1Q13564 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAE1Q13564 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAE1Q13564 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAE1Q13564 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAE1Q13564 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NAE1Q13564 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NAE1Q13564 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NAE1Q13564 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NAE1Q13564 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NAE1Q13564 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NAE1Q13564 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms