Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NAE1Q13564 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NAE1Q13564 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NAE1Q13564 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NAE1Q13564 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NAE1Q13564 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NAE1Q13564 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NAE1Q13564 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NAE1Q13564 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NAE1Q13564 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NAE1Q13564 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NAE1Q13564 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NAE1Q13564 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NAE1Q13564 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NAE1Q13564 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NAE1Q13564 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NAE1Q13564 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NAE1Q13564 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NAE1Q13564 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NAE1Q13564 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NAE1Q13564 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NAE1Q13564 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NAE1Q13564 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NAE1Q13564 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NAE1Q13564 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NAE1Q13564 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NAE1Q13564 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NAE1Q13564 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NAE1Q13564 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NAE1Q13564 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NAE1Q13564 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NAE1Q13564 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NAE1Q13564 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NAE1Q13564 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NAE1Q13564 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NAE1Q13564 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NAE1Q13564 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NAE1Q13564 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NAE1Q13564 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NAE1Q13564 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NAE1Q13564 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NAE1Q13564 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NAE1Q13564 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NAE1Q13564 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NAE1Q13564 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NAE1Q13564 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NAE1Q13564 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NAE1Q13564 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NAE1Q13564 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NAE1Q13564 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NAE1Q13564 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NAE1Q13564 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NAE1Q13564 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NAE1Q13564 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NAE1Q13564 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NAE1Q13564 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NAE1Q13564 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NAE1Q13564 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NAE1Q13564 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NAE1Q13564 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NAE1Q13564 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NAE1Q13564 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NAE1Q13564 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NAE1Q13564 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NAE1Q13564 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NAE1Q13564 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NAE1Q13564 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NAE1Q13564 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NAE1Q13564 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAE1Q13564 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NAE1Q13564 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NAE1Q13564 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NAE1Q13564 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NAE1Q13564 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAE1Q13564 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NAE1Q13564 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NAE1Q13564 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAE1Q13564 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAE1Q13564 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAE1Q13564 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAE1Q13564 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAE1Q13564 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAE1Q13564 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAE1Q13564 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAE1Q13564 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAE1Q13564 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAE1Q13564 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAE1Q13564 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NAE1Q13564 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAE1Q13564 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAE1Q13564 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NAE1Q13564 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAE1Q13564 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAE1Q13564 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAE1Q13564 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAE1Q13564 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NAE1Q13564 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAE1Q13564 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAE1Q13564 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAE1Q13564 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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