Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX16P57768 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX16P57768 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX16P57768 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX16P57768 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX16P57768 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX16P57768 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX16P57768 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX16P57768 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX16P57768 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX16P57768 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX16P57768 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX16P57768 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX16P57768 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX16P57768 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX16P57768 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX16P57768 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNX16P57768 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX16P57768 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX16P57768 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX16P57768 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX16P57768 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX16P57768 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX16P57768 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX16P57768 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX16P57768 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX16P57768 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX16P57768 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX16P57768 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX16P57768 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX16P57768 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX16P57768 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX16P57768 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX16P57768 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX16P57768 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX16P57768 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX16P57768 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX16P57768 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SNX16P57768 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SNX16P57768 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX16P57768 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX16P57768 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX16P57768 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX16P57768 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX16P57768 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX16P57768 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX16P57768 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX16P57768 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX16P57768 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX16P57768 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX16P57768 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX16P57768 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX16P57768 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX16P57768 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX16P57768 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX16P57768 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX16P57768 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SNX16P57768 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX16P57768 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX16P57768 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX16P57768 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX16P57768 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX16P57768 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX16P57768 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX16P57768 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX16P57768 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX16P57768 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX16P57768 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX16P57768 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX16P57768 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX16P57768 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX16P57768 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX16P57768 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX16P57768 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX16P57768 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX16P57768 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX16P57768 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX16P57768 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX16P57768 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX16P57768 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX16P57768 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX16P57768 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX16P57768 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX16P57768 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX16P57768 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX16P57768 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX16P57768 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX16P57768 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX16P57768 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX16P57768 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX16P57768 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX16P57768 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX16P57768 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX16P57768 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX16P57768 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX16P57768 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX16P57768 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX16P57768 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX16P57768 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX16P57768 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms