Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SNX16P57768 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNX16P57768 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SNX16P57768 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SNX16P57768 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SNX16P57768 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SNX16P57768 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNX16P57768 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SNX16P57768 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SNX16P57768 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SNX16P57768 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SNX16P57768 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNX16P57768 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNX16P57768 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNX16P57768 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SNX16P57768 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SNX16P57768 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNX16P57768 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SNX16P57768 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SNX16P57768 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNX16P57768 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNX16P57768 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNX16P57768 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNX16P57768 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SNX16P57768 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNX16P57768 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNX16P57768 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNX16P57768 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SNX16P57768 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNX16P57768 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SNX16P57768 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNX16P57768 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNX16P57768 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNX16P57768 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SNX16P57768 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SNX16P57768 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNX16P57768 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNX16P57768 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNX16P57768 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNX16P57768 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SNX16P57768 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SNX16P57768 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SNX16P57768 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNX16P57768 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX16P57768 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNX16P57768 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SNX16P57768 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNX16P57768 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX16P57768 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNX16P57768 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX16P57768 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNX16P57768 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SNX16P57768 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SNX16P57768 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SNX16P57768 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX16P57768 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX16P57768 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX16P57768 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SNX16P57768 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SNX16P57768 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNX16P57768 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNX16P57768 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX16P57768 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX16P57768 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX16P57768 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX16P57768 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX16P57768 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNX16P57768 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX16P57768 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX16P57768 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX16P57768 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX16P57768 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX16P57768 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SNX16P57768 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SNX16P57768 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNX16P57768 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNX16P57768 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX16P57768 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX16P57768 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX16P57768 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SNX16P57768 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNX16P57768 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX16P57768 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX16P57768 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNX16P57768 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX16P57768 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX16P57768 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX16P57768 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX16P57768 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX16P57768 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX16P57768 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX16P57768 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNX16P57768 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX16P57768 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX16P57768 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX16P57768 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX16P57768 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX16P57768 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX16P57768 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNX16P57768 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms