Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD4P55036 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD4P55036 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD4P55036 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD4P55036 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD4P55036 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMD4P55036 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD4P55036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD4P55036 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PSMD4P55036 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD4P55036 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD4P55036 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD4P55036 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD4P55036 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD4P55036 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD4P55036 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD4P55036 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD4P55036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD4P55036 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD4P55036 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD4P55036 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD4P55036 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD4P55036 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms