Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST4P01036 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CST4P01036 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CST4P01036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST4P01036 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST4P01036 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST4P01036 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CST4P01036 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST4P01036 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CST4P01036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CST4P01036 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CST4P01036 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CST4P01036 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST4P01036 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST4P01036 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST4P01036 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST4P01036 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST4P01036 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CST4P01036 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CST4P01036 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CST4P01036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CST4P01036 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST4P01036 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST4P01036 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST4P01036 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST4P01036 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST4P01036 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CST4P01036 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CST4P01036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CST4P01036 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CST4P01036 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CST4P01036 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CST4P01036 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CST4P01036 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CST4P01036 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CST4P01036 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CST4P01036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CST4P01036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CST4P01036 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CST4P01036 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CST4P01036 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CST4P01036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST4P01036 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST4P01036 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST4P01036 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST4P01036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST4P01036 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST4P01036 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST4P01036 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST4P01036 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST4P01036 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST4P01036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST4P01036 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CST4P01036 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CST4P01036 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST4P01036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST4P01036 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST4P01036 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST4P01036 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST4P01036 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST4P01036 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST4P01036 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CST4P01036 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST4P01036 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST4P01036 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST4P01036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST4P01036 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CST4P01036 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST4P01036 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST4P01036 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CST4P01036 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CST4P01036 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CST4P01036 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CST4P01036 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CST4P01036 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CST4P01036 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST4P01036 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST4P01036 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST4P01036 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST4P01036 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST4P01036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST4P01036 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST4P01036 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST4P01036 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST4P01036 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST4P01036 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST4P01036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST4P01036 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CST4P01036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST4P01036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST4P01036 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST4P01036 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST4P01036 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST4P01036 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST4P01036 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST4P01036 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST4P01036 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST4P01036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST4P01036 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST4P01036 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms