Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CST4P01036 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CST4P01036 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CST4P01036 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CST4P01036 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CST4P01036 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CST4P01036 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST4P01036 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST4P01036 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST4P01036 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST4P01036 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CST4P01036 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CST4P01036 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CST4P01036 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CST4P01036 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CST4P01036 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CST4P01036 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CST4P01036 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CST4P01036 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CST4P01036 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CST4P01036 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CST4P01036 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CST4P01036 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CST4P01036 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CST4P01036 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CST4P01036 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CST4P01036 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CST4P01036 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CST4P01036 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CST4P01036 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CST4P01036 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CST4P01036 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CST4P01036 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CST4P01036 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CST4P01036 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CST4P01036 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CST4P01036 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CST4P01036 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CST4P01036 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CST4P01036 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CST4P01036 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CST4P01036 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CST4P01036 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CST4P01036 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CST4P01036 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CST4P01036 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CST4P01036 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CST4P01036 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST4P01036 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST4P01036 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST4P01036 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST4P01036 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST4P01036 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST4P01036 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CST4P01036 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CST4P01036 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CST4P01036 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CST4P01036 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CST4P01036 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CST4P01036 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CST4P01036 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST4P01036 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST4P01036 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CST4P01036 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST4P01036 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST4P01036 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST4P01036 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CST4P01036 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CST4P01036 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CST4P01036 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CST4P01036 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CST4P01036 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CST4P01036 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST4P01036 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST4P01036 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CST4P01036 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CST4P01036 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CST4P01036 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CST4P01036 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CST4P01036 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CST4P01036 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST4P01036 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST4P01036 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST4P01036 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CST4P01036 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST4P01036 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST4P01036 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CST4P01036 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CST4P01036 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST4P01036 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST4P01036 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CST4P01036 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CST4P01036 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CST4P01036 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CST4P01036 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CST4P01036 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CST4P01036 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CST4P01036 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CST4P01036 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CST4P01036 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms