Protein–RNA interactions for Protein: O95167

NDUFA3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA3O95167 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA3O95167 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA3O95167 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA3O95167 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA3O95167 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA3O95167 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDUFA3O95167 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA3O95167 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA3O95167 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA3O95167 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA3O95167 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA3O95167 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA3O95167 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA3O95167 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA3O95167 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA3O95167 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms