Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP4O75096 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP4O75096 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRP4O75096 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP4O75096 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP4O75096 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP4O75096 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP4O75096 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP4O75096 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP4O75096 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP4O75096 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP4O75096 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP4O75096 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP4O75096 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP4O75096 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP4O75096 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP4O75096 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP4O75096 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP4O75096 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP4O75096 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP4O75096 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP4O75096 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP4O75096 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP4O75096 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRP4O75096 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRP4O75096 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRP4O75096 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRP4O75096 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRP4O75096 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRP4O75096 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRP4O75096 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRP4O75096 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRP4O75096 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRP4O75096 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRP4O75096 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRP4O75096 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRP4O75096 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRP4O75096 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP4O75096 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP4O75096 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP4O75096 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP4O75096 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP4O75096 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP4O75096 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP4O75096 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP4O75096 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP4O75096 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP4O75096 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRP4O75096 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRP4O75096 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP4O75096 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP4O75096 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP4O75096 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP4O75096 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP4O75096 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP4O75096 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP4O75096 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP4O75096 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP4O75096 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP4O75096 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP4O75096 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRP4O75096 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRP4O75096 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRP4O75096 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRP4O75096 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRP4O75096 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRP4O75096 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP4O75096 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP4O75096 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP4O75096 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRP4O75096 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP4O75096 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP4O75096 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP4O75096 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP4O75096 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP4O75096 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP4O75096 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP4O75096 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP4O75096 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP4O75096 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP4O75096 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP4O75096 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP4O75096 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP4O75096 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP4O75096 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP4O75096 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP4O75096 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP4O75096 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP4O75096 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP4O75096 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP4O75096 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP4O75096 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP4O75096 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP4O75096 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP4O75096 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP4O75096 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP4O75096 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP4O75096 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP4O75096 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP4O75096 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms