Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 PYCR1-208ENST00000579366 681 ntTSL 310.53□□□□□ -0.724e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 PPFIA1-211ENST00000528750 1168 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 PPFIA1-213ENST00000530294 977 ntTSL 58.41□□□□□ -1.064e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 PPFIA1-217ENST00000530798 710 ntTSL 56.27□□□□□ -1.414e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 PPFIA1-205ENST00000526074 573 ntTSL 36.18□□□□□ -1.424e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 PPFIA1-224ENST00000533894 553 ntTSL 45.19□□□□□ -1.584e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-211ENST00000445721 443 ntTSL 522.64■■□□□ 1.219e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-207ENST00000424634 579 ntTSL 317.37■□□□□ 0.379e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-218ENST00000493456 478 ntTSL 316.87■□□□□ 0.299e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-208ENST00000430547 537 ntTSL 416.57■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.049e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-209ENST00000432340 551 ntTSL 515.25■□□□□ 0.039e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-210ENST00000434760 763 ntTSL 414.78□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-213ENST00000461437 531 ntTSL 414.61□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-204ENST00000417702 584 ntTSL 414.41□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-219ENST00000497960 986 ntTSL 214.41□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-215ENST00000484186 431 ntTSL 58.91□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 NUP50-212ENST00000461194 550 ntTSL 47.54□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 WDR45B-204ENST00000571835 869 ntTSL 58.24□□□□□ -1.091e-10■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-14■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.973e-14■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 RHBDD1-203ENST00000409053 538 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.043e-14■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 RHBDD1-214ENST00000493526 1003 ntTSL 37.99□□□□□ -1.133e-14■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 RHBDD1-213ENST00000491490 801 ntTSL 1 (best)7.09□□□□□ -1.273e-14■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 58.73□□□□□ -1.012e-7■■■■□ 25.2
CSTF2TQ9H0L4 PPARA-206ENST00000440343 368 ntTSL 1 (best)25.86■■□□□ 1.732e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PPARA-207ENST00000460086 433 ntTSL 1 (best)21.74■■□□□ 1.072e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PPARA-204ENST00000415785 531 ntTSL 414.78□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PPARA-205ENST00000420804 572 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.22e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 FAM122B-206ENST00000486347 1381 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 215.93■□□□□ 0.142e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-208ENST00000578476 573 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-214ENST00000580461 909 ntTSL 211.99□□□□□ -0.492e-11■■■■□ 25.1
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CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 310.95□□□□□ -0.662e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-213ENST00000579139 568 ntTSL 410.84□□□□□ -0.672e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 210.07□□□□□ -0.82e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 49.93□□□□□ -0.822e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 49.81□□□□□ -0.842e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-215ENST00000580886 562 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-231ENST00000584054 716 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 58.85□□□□□ -0.992e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 48.39□□□□□ -1.072e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 48.16□□□□□ -1.12e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 27.05□□□□□ -1.282e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 35.78□□□□□ -1.482e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 45.03□□□□□ -1.62e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-224ENST00000582213 560 ntTSL 44.34□□□□□ -1.712e-11■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 314.48□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 316.32■□□□□ 0.25e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF581-201ENST00000270451 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 C10orf10-203ENST00000496638 868 ntTSL 320.21■□□□□ 0.839e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.122e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.043e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 211.11□□□□□ -0.633e-9■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)22.17■■□□□ 1.144e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)21.28■■□□□ 12e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)21.28■■□□□ 12e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.942e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)17.15■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 516.98■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 314.25□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 514.2□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 313.23□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 412.07□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 STMN3-203ENST00000631920 970 ntTSL 217.72■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -05e-7■■■■□ 25.1
CSTF2TQ9H0L4 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-10■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.787e-9■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.93■■□□□ 1.262e-11■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-7■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 SUMO3-205ENST00000466861 753 ntTSL 221.65■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25
CSTF2TQ9H0L4 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 25
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