RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460086.1

PPARA-207, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor alpha, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PPARA, Length 433 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARA-207ENST00000460086 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.4■■■■■ 6.78
PPARA-207ENST00000460086 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.62■■■■■ 5.85
PPARA-207ENST00000460086 ABCC9O60706 1549 aa51.6■■■■■ 5.85
PPARA-207ENST00000460086 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.14■■■■■ 5.46
PPARA-207ENST00000460086 NACADO15069 1562 aa48.76■■■■■ 5.4
PPARA-207ENST00000460086 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.48■■■■■ 5.35
PPARA-207ENST00000460086 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.34■■■■■ 5.33
PPARA-207ENST00000460086 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.07■■■■■ 5.29
PPARA-207ENST00000460086 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
PPARA-207ENST00000460086 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.99■■■■■ 5.27
PPARA-207ENST00000460086 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.66■■■■■ 5.22
PPARA-207ENST00000460086 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
PPARA-207ENST00000460086 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.4■■■■■ 5.18
PPARA-207ENST00000460086 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.04■■■■■ 5.12
PPARA-207ENST00000460086 SCRIBQ14160 1630 aa47.02■■■■■ 5.12
PPARA-207ENST00000460086 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.63■■■■■ 5.06
PPARA-207ENST00000460086 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
PPARA-207ENST00000460086 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.49■■■■■ 5.03
PPARA-207ENST00000460086 NCAPD3P42695 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
PPARA-207ENST00000460086 SMARCA4P51532 1647 aa44.83■■■■■ 4.77
PPARA-207ENST00000460086 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.83■■■■■ 4.77
PPARA-207ENST00000460086 SMARCA2P51531 1590 aa44.76■■■■■ 4.76
PPARA-207ENST00000460086 HMGXB3Q12766 1538 aa44.68■■■■■ 4.74
PPARA-207ENST00000460086 ERCC6Q03468 1493 aa44.6■■■■■ 4.73
PPARA-207ENST00000460086 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
PPARA-207ENST00000460086 CUX2O14529 1486 aa44.5■■■■■ 4.71
PPARA-207ENST00000460086 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.47■■■■■ 4.71
PPARA-207ENST00000460086 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PPARA-207ENST00000460086 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.36■■■■■ 4.69
PPARA-207ENST00000460086 NESP48681 1621 aa44.31■■■■■ 4.68
PPARA-207ENST00000460086 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.22■■■■■ 4.67
PPARA-207ENST00000460086 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.03■■■■■ 4.64
PPARA-207ENST00000460086 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
PPARA-207ENST00000460086 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.81■■■■■ 4.6
PPARA-207ENST00000460086 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.74■■■■■ 4.59
PPARA-207ENST00000460086 WIZO95785 1651 aa43.74■■■■■ 4.59
PPARA-207ENST00000460086 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.59■■■■■ 4.57
PPARA-207ENST00000460086 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.54
PPARA-207ENST00000460086 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
PPARA-207ENST00000460086 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
PPARA-207ENST00000460086 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.22■■■■■ 4.51
PPARA-207ENST00000460086 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
PPARA-207ENST00000460086 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.14■■■■■ 4.5
PPARA-207ENST00000460086 CFTRP13569 1480 aa43.1■■■■■ 4.49
PPARA-207ENST00000460086 PRDM2Q13029 1718 aa42.81■■■■■ 4.44
PPARA-207ENST00000460086 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PPARA-207ENST00000460086 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.64■■■■■ 4.42
PPARA-207ENST00000460086 TRIM41Q8WV44 630 aa42.56■■■■■ 4.4
PPARA-207ENST00000460086 OSCARQ8IYS5 282 aa42.43■■■■■ 4.38
PPARA-207ENST00000460086 IFT140Q96RY7 1462 aa42.33■■■■■ 4.37
PPARA-207ENST00000460086 TOPBP1Q92547 1522 aa42.31■■■■■ 4.36
PPARA-207ENST00000460086 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
PPARA-207ENST00000460086 ABCC8Q09428 1581 aa42.23■■■■■ 4.35
PPARA-207ENST00000460086 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.19■■■■■ 4.34
PPARA-207ENST00000460086 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
PPARA-207ENST00000460086 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.95■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.95■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.95■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
PPARA-207ENST00000460086 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
PPARA-207ENST00000460086 CHD1O14646 1710 aa41.82■■■■■ 4.29
PPARA-207ENST00000460086 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
PPARA-207ENST00000460086 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.71■■■■■ 4.27
PPARA-207ENST00000460086 SOGA1O94964 1423 aa41.68■■■■■ 4.26
PPARA-207ENST00000460086 FBLN2P98095 1184 aa41.63■■■■■ 4.25
PPARA-207ENST00000460086 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.62■■■■■ 4.25
PPARA-207ENST00000460086 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
PPARA-207ENST00000460086 WDR97A6NE52 1622 aa41.56■■■■■ 4.24
PPARA-207ENST00000460086 CUX1P39880 1505 aa41.56■■■■■ 4.24
PPARA-207ENST00000460086 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.47■■■■■ 4.23
PPARA-207ENST00000460086 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.44■■■■■ 4.22
PPARA-207ENST00000460086 ARAP1Q96P48 1450 aa41.35■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 GRIN2BQ13224 1484 aa41.34■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 SYNJ1O43426 1573 aa41.28■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 PBRM1Q86U86 1689 aa41.26■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.26■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 SYNJ2O15056 1496 aa41.21■■■■■ 4.19
PPARA-207ENST00000460086 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.19■■■■■ 4.18
PPARA-207ENST00000460086 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.17
PPARA-207ENST00000460086 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.11■■■■■ 4.17
PPARA-207ENST00000460086 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
PPARA-207ENST00000460086 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
PPARA-207ENST00000460086 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.94■■■■■ 4.14
PPARA-207ENST00000460086 TOP2BQ02880 1626 aa40.92■■■■■ 4.14
PPARA-207ENST00000460086 GRIN2AQ12879 1464 aa40.82■■■■■ 4.12
PPARA-207ENST00000460086 ADAMTS12P58397 1594 aa40.82■■■■■ 4.12
PPARA-207ENST00000460086 CEP170Q5SW79 1584 aa40.68■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.66■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 NUP160Q12769 1436 aa40.65■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.64■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.61■■■■■ 4.09
PPARA-207ENST00000460086 SHROOM2Q13796 1616 aa40.53■■■■■ 4.08
PPARA-207ENST00000460086 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
PPARA-207ENST00000460086 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.25■■■■■ 4.03
PPARA-207ENST00000460086 JPH4Q96JJ6 628 aa40.21■■■■■ 4.03
PPARA-207ENST00000460086 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
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