RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445721.5

NUP50-211, Transcript of nucleoporin 50, humanhuman

TSL 5

Gene NUP50, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-211ENST00000445721 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.07■■■■■ 7.21
NUP50-211ENST00000445721 ABCC9O60706 1549 aa54.8■■■■■ 6.36
NUP50-211ENST00000445721 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.06■■■■■ 6.24
NUP50-211ENST00000445721 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52■■■■■ 5.91
NUP50-211ENST00000445721 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.82■■■■■ 5.89
NUP50-211ENST00000445721 NACADO15069 1562 aa51.32■■■■■ 5.81
NUP50-211ENST00000445721 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.17■■■■■ 5.78
NUP50-211ENST00000445721 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.01■■■■■ 5.76
NUP50-211ENST00000445721 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.58■■■■■ 5.69
NUP50-211ENST00000445721 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.37■■■■■ 5.65
NUP50-211ENST00000445721 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.33■■■■■ 5.65
NUP50-211ENST00000445721 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
NUP50-211ENST00000445721 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.53■■■■■ 5.52
NUP50-211ENST00000445721 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.52■■■■■ 5.52
NUP50-211ENST00000445721 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.41■■■■■ 5.5
NUP50-211ENST00000445721 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.41■■■■■ 5.5
NUP50-211ENST00000445721 SCRIBQ14160 1630 aa49.32■■■■■ 5.49
NUP50-211ENST00000445721 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.15■■■■■ 5.46
NUP50-211ENST00000445721 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.16■■■■■ 5.3
NUP50-211ENST00000445721 NCAPD3P42695 1498 aa47.42■■■■■ 5.18
NUP50-211ENST00000445721 CUX2O14529 1486 aa47.41■■■■■ 5.18
NUP50-211ENST00000445721 ERCC6Q03468 1493 aa47.36■■■■■ 5.17
NUP50-211ENST00000445721 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.2■■■■■ 5.15
NUP50-211ENST00000445721 SMARCA2P51531 1590 aa47■■■■■ 5.11
NUP50-211ENST00000445721 HMGXB3Q12766 1538 aa46.95■■■■■ 5.11
NUP50-211ENST00000445721 SMARCA4P51532 1647 aa46.95■■■■■ 5.11
NUP50-211ENST00000445721 NESP48681 1621 aa46.9■■■■■ 5.1
NUP50-211ENST00000445721 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
NUP50-211ENST00000445721 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
NUP50-211ENST00000445721 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.46■■■■■ 5.03
NUP50-211ENST00000445721 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
NUP50-211ENST00000445721 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.4■■■■■ 5.02
NUP50-211ENST00000445721 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.3■■■■■ 5
NUP50-211ENST00000445721 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.23■■■■■ 4.99
NUP50-211ENST00000445721 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.19■■■■■ 4.98
NUP50-211ENST00000445721 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.98■■■■■ 4.95
NUP50-211ENST00000445721 TRIM41Q8WV44 630 aa45.88■■■■■ 4.94
NUP50-211ENST00000445721 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.84■■■■■ 4.93
NUP50-211ENST00000445721 WDR62O43379 1518 aa45.7■■■■■ 4.91
NUP50-211ENST00000445721 WIZO95785 1651 aa45.69■■■■■ 4.9
NUP50-211ENST00000445721 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.54■■■■■ 4.88
NUP50-211ENST00000445721 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.45■■■■■ 4.87
NUP50-211ENST00000445721 CFTRP13569 1480 aa45.3■■■■■ 4.84
NUP50-211ENST00000445721 OSCARQ8IYS5 282 aa45.27■■■■■ 4.84
NUP50-211ENST00000445721 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
NUP50-211ENST00000445721 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
NUP50-211ENST00000445721 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
NUP50-211ENST00000445721 PRDM2Q13029 1718 aa44.67■■■■■ 4.74
NUP50-211ENST00000445721 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
NUP50-211ENST00000445721 IFT140Q96RY7 1462 aa44.66■■■■■ 4.74
NUP50-211ENST00000445721 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.63■■■■■ 4.73
NUP50-211ENST00000445721 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.63■■■■■ 4.73
NUP50-211ENST00000445721 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.63■■■■■ 4.73
NUP50-211ENST00000445721 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.61■■■■■ 4.73
NUP50-211ENST00000445721 TOPBP1Q92547 1522 aa44.51■■■■■ 4.72
NUP50-211ENST00000445721 ARHGEF11O15085 1522 aa44.45■■■■■ 4.71
NUP50-211ENST00000445721 ABCC8Q09428 1581 aa44.36■■■■■ 4.69
NUP50-211ENST00000445721 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
NUP50-211ENST00000445721 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.29■■■■■ 4.68
NUP50-211ENST00000445721 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.26■■■■■ 4.68
NUP50-211ENST00000445721 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.22■■■■■ 4.67
NUP50-211ENST00000445721 FBLN2P98095 1184 aa44.14■■■■■ 4.66
NUP50-211ENST00000445721 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
NUP50-211ENST00000445721 CHD1O14646 1710 aa44.1■■■■■ 4.65
NUP50-211ENST00000445721 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
NUP50-211ENST00000445721 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
NUP50-211ENST00000445721 ARAP1Q96P48 1450 aa43.97■■■■■ 4.63
NUP50-211ENST00000445721 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.91■■■■■ 4.62
NUP50-211ENST00000445721 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
NUP50-211ENST00000445721 SOGA1O94964 1423 aa43.86■■■■■ 4.61
NUP50-211ENST00000445721 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.7■■■■■ 4.59
NUP50-211ENST00000445721 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
NUP50-211ENST00000445721 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.66■■■■■ 4.58
NUP50-211ENST00000445721 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.58■■■■■ 4.57
NUP50-211ENST00000445721 WDR97A6NE52 1622 aa43.57■■■■■ 4.57
NUP50-211ENST00000445721 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
NUP50-211ENST00000445721 CUX1P39880 1505 aa43.53■■■■■ 4.56
NUP50-211ENST00000445721 SYNJ1O43426 1573 aa43.52■■■■■ 4.56
NUP50-211ENST00000445721 GRIN2BQ13224 1484 aa43.51■■■■■ 4.56
NUP50-211ENST00000445721 SYNJ2O15056 1496 aa43.42■■■■■ 4.54
NUP50-211ENST00000445721 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.29■■■■■ 4.52
NUP50-211ENST00000445721 PBRM1Q86U86 1689 aa43.21■■■■■ 4.51
NUP50-211ENST00000445721 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
NUP50-211ENST00000445721 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.12■■■■■ 4.49
NUP50-211ENST00000445721 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.06■■■■■ 4.48
NUP50-211ENST00000445721 GRIN2AQ12879 1464 aa42.94■■■■■ 4.46
NUP50-211ENST00000445721 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.91■■■■■ 4.46
NUP50-211ENST00000445721 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.88■■■■■ 4.45
NUP50-211ENST00000445721 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
NUP50-211ENST00000445721 NUP160Q12769 1436 aa42.8■■■■■ 4.44
NUP50-211ENST00000445721 ADAMTS12P58397 1594 aa42.79■■■■■ 4.44
NUP50-211ENST00000445721 CEP170Q5SW79 1584 aa42.79■■■■■ 4.44
NUP50-211ENST00000445721 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.71■■■■■ 4.43
NUP50-211ENST00000445721 TOP2BQ02880 1626 aa42.63■■■■■ 4.41
NUP50-211ENST00000445721 SHROOM2Q13796 1616 aa42.63■■■■■ 4.41
NUP50-211ENST00000445721 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.6■■■■■ 4.41
NUP50-211ENST00000445721 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.55■■■■■ 4.4
NUP50-211ENST00000445721 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
NUP50-211ENST00000445721 JPH4Q96JJ6 628 aa42.47■■■■■ 4.39
NUP50-211ENST00000445721 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.39■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms