Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.382e-8■■■□□ 17.8
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NOLC1Q14978 ZPR1-204ENST00000429220 2364 ntTSL 515.99■□□□□ 0.156e-9■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.36e-9■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 ZPR1-206ENST00000444935 2497 ntTSL 512.9□□□□□ -0.346e-9■■■□□ 17.7
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NOLC1Q14978 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.983e-9■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-7■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 514.72□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 17.7
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NOLC1Q14978 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.675e-9■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 ZKSCAN1-203ENST00000432317 573 ntTSL 47.32□□□□□ -1.245e-9■■■□□ 17.7
NOLC1Q14978 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-19■■■□□ 17.7
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NOLC1Q14978 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.823e-10■■■□□ 17.6
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NOLC1Q14978 LETMD1-202ENST00000380135 1566 ntTSL 317.59■□□□□ 0.418e-7■■■□□ 17.6
NOLC1Q14978 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.388e-7■■■□□ 17.6
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NOLC1Q14978 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.218e-7■■■□□ 17.6
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NOLC1Q14978 LETMD1-238ENST00000623495 2948 nt8.39□□□□□ -1.078e-7■■■□□ 17.6
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NOLC1Q14978 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-8■■■□□ 17.6
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NOLC1Q14978 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 17.5
NOLC1Q14978 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■■■□□ 17.5
NOLC1Q14978 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.873e-6■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.991e-44■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 EXOC4-208ENST00000468932 753 ntTSL 312.98□□□□□ -0.339e-13■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 EXOC4-207ENST00000466000 555 ntTSL 412.23□□□□□ -0.459e-13■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.989e-13■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 GOLGA8B-210ENST00000569100 6488 ntTSL 512.16□□□□□ -0.461e-9■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-9■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.861e-9■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 CDYL-209ENST00000491864 614 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-9■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 EIF3L-208ENST00000451427 583 ntTSL 45.53□□□□□ -1.528e-9■■■□□ 17.4
NOLC1Q14978 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.481e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 513.97□□□□□ -0.171e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.841e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-214ENST00000515818 572 ntTSL 57.14□□□□□ -1.271e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 26.65□□□□□ -1.341e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.451e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 34.69□□□□□ -1.661e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.661e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 24.25□□□□□ -1.731e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.791e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.31e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.261e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 211□□□□□ -0.651e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -11e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-17■■■□□ 17.3
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