Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.88e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.678e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.638e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.468e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.458e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.418e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.348e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 NOC2L-205ENST00000487214 865 ntTSL 323.43■■□□□ 1.348e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RTL10-204ENST00000416337 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.21■■□□□ 1.318e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.28e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.178e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SMG1P3-201ENST00000435197 416 ntTSL 322.16■■□□□ 1.148e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 ATF5-203ENST00000596658 722 ntTSL 222.13■■□□□ 1.138e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-208ENST00000492252 1136 ntTSL 321.88■■□□□ 1.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-211ENST00000524805 982 ntTSL 521.88■■□□□ 1.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 321.72■■□□□ 1.078e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.018e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 321.24■□□□□ 0.998e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 221.24■□□□□ 0.998e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.988e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 420.82■□□□□ 0.928e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PPP2R1A-204ENST00000462047 561 ntTSL 220.62■□□□□ 0.898e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 520.38■□□□□ 0.858e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.858e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.848e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-205ENST00000507302 742 ntTSL 320.23■□□□□ 0.838e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 320.2■□□□□ 0.828e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.798e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.788e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 319.89■□□□□ 0.778e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.768e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.658e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.658e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.628e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 218.87■□□□□ 0.618e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.618e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PPP2R1A-203ENST00000454220 1233 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.68e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.588e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 518.49■□□□□ 0.558e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.548e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MFN2-204ENST00000484391 294 ntTSL 318.2■□□□□ 0.58e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.468e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.278e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 416.76■□□□□ 0.278e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 316.49■□□□□ 0.238e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CA5BP1-206ENST00000448692 443 ntTSL 516.45■□□□□ 0.228e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 216.4■□□□□ 0.228e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MFN2-206ENST00000497302 645 ntTSL 216.31■□□□□ 0.28e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.28e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.188e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.188e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.078e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MDH2-202ENST00000424167 681 ntTSL 215.38■□□□□ 0.058e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CLCN7-205ENST00000563642 4184 ntTSL 215.29■□□□□ 0.048e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MYO19-204ENST00000610992 5743 ntTSL 215.19■□□□□ 0.028e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CA5BP1-202ENST00000380333 926 ntTSL 215.05■□□□□ -08e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.088e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.238e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CA5BP1-203ENST00000380334 1264 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.238e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.248e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.288e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-207ENST00000509995 560 ntTSL 313.31□□□□□ -0.288e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MYO19-226ENST00000621550 4299 ntTSL 513.03□□□□□ -0.328e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-201ENST00000290330 951 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.368e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CA5BP1-204ENST00000380336 843 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.418e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 212.22□□□□□ -0.458e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PPP2R1A-208ENST00000473820 646 ntTSL 211.99□□□□□ -0.498e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-214ENST00000515174 823 ntTSL 211.93□□□□□ -0.58e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.518e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-211ENST00000512243 863 ntTSL 211.3□□□□□ -0.68e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.648e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 510.88□□□□□ -0.678e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PTTG1-203ENST00000517480 684 ntTSL 510.23□□□□□ -0.778e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.818e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MFN2-205ENST00000490079 445 ntTSL 29.99□□□□□ -0.818e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.838e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 39.19□□□□□ -0.948e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PTTG1-207ENST00000524244 434 ntTSL 28.86□□□□□ -0.998e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC8.34□□□□□ -1.078e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 PTTG1-206ENST00000523659 851 ntTSL 23.73□□□□□ -1.818e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.188e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 ACVR1-208ENST00000440523 534 ntTSL 310.35□□□□□ -0.757e-10■■■■□ 21.2
AATFQ9NY61 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 21.1
AATFQ9NY61 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 232.53■■■□□ 2.82e-6■■■■□ 21.1
AATFQ9NY61 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 332.53■■■□□ 2.82e-6■■■■□ 21.1
AATFQ9NY61 ABHD5-207ENST00000486764 618 ntTSL 224.83■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 21
AATFQ9NY61 ABHD5-203ENST00000454293 464 ntTSL 324.55■■□□□ 1.523e-6■■■■□ 21
AATFQ9NY61 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.313e-6■■■■□ 21
AATFQ9NY61 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 322.33■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 21
AATFQ9NY61 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 416.66■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 21
AATFQ9NY61 RACK1-207ENST00000503170 461 ntTSL 420.49■□□□□ 0.871e-323■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RACK1-232ENST00000514318 581 ntTSL 319.85■□□□□ 0.771e-323■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.06□□□□□ -1.281e-323■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 525.28■■□□□ 1.642e-6■■■■□ 20.9
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