Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-204ENST00000571541 2310 ntTSL 220.25■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-205ENST00000519876 585 ntTSL 319.61■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 CDCA5-208ENST00000529290 789 ntTSL 519.52■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PTPA-225ENST00000455240 645 ntTSL 319.12■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-210ENST00000575434 851 ntTSL 318.89■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ERGIC3-217ENST00000488935 389 ntTSL 218.8■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 518.79■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RAB3GAP2-201ENST00000237724 821 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-203ENST00000571078 724 ntTSL 218.62■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ERGIC3-216ENST00000488384 766 ntTSL 218.05■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PLSCR3-211ENST00000575543 1672 ntTSL 216.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 SENP3-209ENST00000610454 606 ntTSL 315.26■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-210ENST00000588413 747 ntTSL 215.02■□□□□ -03e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TSEN54-206ENST00000579449 786 ntTSL 214.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 BRF2-204ENST00000522539 473 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 513.5□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PELP1-210ENST00000573506 415 ntTSL 213.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 STAG3L4-203ENST00000472361 1039 ntTSL 513.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TSEN54-204ENST00000577197 650 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 MYO19-210ENST00000612392 840 ntTSL 213.21□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 GLI4-206ENST00000520021 361 ntTSL 313.1□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 412.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 STAG3L4-202ENST00000416602 2143 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 412.11□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 BRF2-203ENST00000521170 550 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 511.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ATAD2B-205ENST00000458510 554 ntTSL 410.9□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 RAB3GAP2-207ENST00000478976 575 ntTSL 410.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 MKNK1-216ENST00000524417 531 ntTSL 410.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 TMEM87A-205ENST00000562946 1430 ntTSL 210.03□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 THADA-208ENST00000407351 3678 ntTSL 29.75□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 29.7
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BUD13Q9BRD0 MKNK1-206ENST00000460098 337 ntTSL 39.24□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 SENP3-210ENST00000619785 634 ntTSL 38.97□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.79□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-210ENST00000553024 2797 ntTSL 27.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NCOA1-208ENST00000483904 711 ntTSL 37.53□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NRDC-204ENST00000464385 472 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM87A-213ENST00000569075 1369 ntTSL 26.36□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 THADA-203ENST00000402796 2749 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM87A-206ENST00000563371 867 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 THADA-210ENST00000436947 611 ntTSL 35.96□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-205ENST00000550261 747 ntTSL 55.9□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-207ENST00000551582 563 ntTSL 45.62□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM87A-211ENST00000568400 905 ntTSL 35.37□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 ATAD2B-206ENST00000474583 3765 ntTSL 25.34□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.684e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.734e-8■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 TMEM87A-204ENST00000561578 528 ntTSL 42.8□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 EDC4-208ENST00000574770 1425 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 29.7
BUD13Q9BRD0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-204ENST00000441883 800 ntTSL 531.5■■■□□ 2.631e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-205ENST00000447696 722 ntTSL 327.49■■□□□ 1.991e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-207ENST00000461550 1478 ntTSL 520.12■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-208ENST00000469744 1467 ntTSL 1 (best)20.12■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-209ENST00000481453 2229 ntTSL 219.75■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 29.6
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