RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587989.1

TMUB2-209, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-209ENST00000587989 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.76■■■■□ 3.64
TMUB2-209ENST00000587989 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.29■■■□□ 2.92
TMUB2-209ENST00000587989 ABCC9O60706 1549 aa32.21■■■□□ 2.75
TMUB2-209ENST00000587989 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TMUB2-209ENST00000587989 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.47■■■□□ 2.63
TMUB2-209ENST00000587989 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.22■■■□□ 2.59
TMUB2-209ENST00000587989 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
TMUB2-209ENST00000587989 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.17■■■□□ 2.58
TMUB2-209ENST00000587989 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.14■■■□□ 2.58
TMUB2-209ENST00000587989 SCRIBQ14160 1630 aa30.5■■■□□ 2.47
TMUB2-209ENST00000587989 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.42■■■□□ 2.46
TMUB2-209ENST00000587989 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.22■■■□□ 2.43
TMUB2-209ENST00000587989 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.433e-6■■■□□ 16
TMUB2-209ENST00000587989 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.18■■■□□ 2.42
TMUB2-209ENST00000587989 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.39■■■□□ 2.3
TMUB2-209ENST00000587989 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
TMUB2-209ENST00000587989 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TMUB2-209ENST00000587989 SMARCA4P51532 1647 aa29.19■■■□□ 2.26
TMUB2-209ENST00000587989 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.13■■■□□ 2.25
TMUB2-209ENST00000587989 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.13■■■□□ 2.25
TMUB2-209ENST00000587989 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.12■■■□□ 2.25
TMUB2-209ENST00000587989 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TMUB2-209ENST00000587989 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.92■■■□□ 2.22
TMUB2-209ENST00000587989 SMARCA2P51531 1590 aa28.89■■■□□ 2.22
TMUB2-209ENST00000587989 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.87■■■□□ 2.21
TMUB2-209ENST00000587989 WIZO95785 1651 aa28.84■■■□□ 2.21
TMUB2-209ENST00000587989 NCAPD3P42695 1498 aa28.82■■■□□ 2.2
TMUB2-209ENST00000587989 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
TMUB2-209ENST00000587989 HMGXB3Q12766 1538 aa28.7■■■□□ 2.19
TMUB2-209ENST00000587989 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
TMUB2-209ENST00000587989 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TMUB2-209ENST00000587989 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.23■■■□□ 2.11
TMUB2-209ENST00000587989 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.03■■■□□ 2.08
TMUB2-209ENST00000587989 NESP48681 1621 aa28.01■■■□□ 2.07
TMUB2-209ENST00000587989 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.96■■■□□ 2.07
TMUB2-209ENST00000587989 CFTRP13569 1480 aa27.95■■■□□ 2.07
TMUB2-209ENST00000587989 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.79■■■□□ 2.04
TMUB2-209ENST00000587989 ERCC6Q03468 1493 aa27.72■■■□□ 2.03
TMUB2-209ENST00000587989 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
TMUB2-209ENST00000587989 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.71■■■□□ 2.03
TMUB2-209ENST00000587989 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.65■■■□□ 2.02
TMUB2-209ENST00000587989 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.62■■■□□ 2.01
TMUB2-209ENST00000587989 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.47■■□□□ 1.99
TMUB2-209ENST00000587989 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
TMUB2-209ENST00000587989 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TMUB2-209ENST00000587989 ABCC8Q09428 1581 aa27.36■■□□□ 1.97
TMUB2-209ENST00000587989 WDR62O43379 1518 aa27.35■■□□□ 1.97
TMUB2-209ENST00000587989 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
TMUB2-209ENST00000587989 TOPBP1Q92547 1522 aa27.31■■□□□ 1.96
TMUB2-209ENST00000587989 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.3■■□□□ 1.96
TMUB2-209ENST00000587989 CUX1P39880 1505 aa27.29■■□□□ 1.96
TMUB2-209ENST00000587989 SYNJ1O43426 1573 aa27.21■■□□□ 1.95
TMUB2-209ENST00000587989 CUX2O14529 1486 aa27.2■■□□□ 1.94
TMUB2-209ENST00000587989 TOP2BQ02880 1626 aa27.16■■□□□ 1.94
TMUB2-209ENST00000587989 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.14■■□□□ 1.94
TMUB2-209ENST00000587989 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.13■■□□□ 1.93
TMUB2-209ENST00000587989 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TMUB2-209ENST00000587989 TRIM41Q8WV44 630 aa27.06■■□□□ 1.92
TMUB2-209ENST00000587989 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.04■■□□□ 1.92
TMUB2-209ENST00000587989 SOGA1O94964 1423 aa27.03■■□□□ 1.92
TMUB2-209ENST00000587989 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.01■■□□□ 1.92
TMUB2-209ENST00000587989 IFT140Q96RY7 1462 aa27.01■■□□□ 1.91
TMUB2-209ENST00000587989 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TMUB2-209ENST00000587989 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.87■■□□□ 1.89
TMUB2-209ENST00000587989 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TMUB2-209ENST00000587989 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TMUB2-209ENST00000587989 WDR97A6NE52 1622 aa26.83■■□□□ 1.88
TMUB2-209ENST00000587989 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.883e-6■■■□□ 18.3
TMUB2-209ENST00000587989 HRCP23327 699 aa26.78■■□□□ 1.88
TMUB2-209ENST00000587989 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.72■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.71■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 KIF27Q86VH2 1401 aa26.71■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 GRIN2BQ13224 1484 aa26.64■■□□□ 1.85
TMUB2-209ENST00000587989 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.63■■□□□ 1.85
TMUB2-209ENST00000587989 PBRM1Q86U86 1689 aa26.59■■□□□ 1.85
TMUB2-209ENST00000587989 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.55■■□□□ 1.84
TMUB2-209ENST00000587989 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.55■■□□□ 1.84
TMUB2-209ENST00000587989 IGF1RP08069 1367 aa26.54■■□□□ 1.84
TMUB2-209ENST00000587989 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TMUB2-209ENST00000587989 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TMUB2-209ENST00000587989 EEA1Q15075 1411 aa26.5■■□□□ 1.83
TMUB2-209ENST00000587989 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.44■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 FBLN2P98095 1184 aa26.43■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 ADAMTS12P58397 1594 aa26.42■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 SYNJ2O15056 1496 aa26.41■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.4■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 CUL7Q14999 1698 aa26.4■■□□□ 1.82
TMUB2-209ENST00000587989 CHD1O14646 1710 aa26.32■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 PRXQ9BXM0 1461 aa26.31■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 GRIN2AQ12879 1464 aa26.29■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.28■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 OSCARQ8IYS5 282 aa26.22■■□□□ 1.79
TMUB2-209ENST00000587989 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.18■■□□□ 1.78
TMUB2-209ENST00000587989 KIF21BO75037 1637 aa26.17■■□□□ 1.78
TMUB2-209ENST00000587989 NUP160Q12769 1436 aa26.15■■□□□ 1.78
TMUB2-209ENST00000587989 CEP170Q5SW79 1584 aa26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms