RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319511.6

TMUB2-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB2, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-201ENST00000319511 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.03■■□□□ 1.92
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TMUB2-201ENST00000319511 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.41■■□□□ 1.34
TMUB2-201ENST00000319511 MYT1Q01538 1121 aa23.29■■□□□ 1.32
TMUB2-201ENST00000319511 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TMUB2-201ENST00000319511 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-201ENST00000319511 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-201ENST00000319511 ABCC9O60706 1549 aa22.3■■□□□ 1.16
TMUB2-201ENST00000319511 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.27■■□□□ 1.16
TMUB2-201ENST00000319511 HRCP23327 699 aa22.09■■□□□ 1.13
TMUB2-201ENST00000319511 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22■■□□□ 1.11
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TMUB2-201ENST00000319511 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
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TMUB2-201ENST00000319511 NACADO15069 1562 aa21.66■■□□□ 1.06
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TMUB2-201ENST00000319511 BCL11AQ9H165 835 aa21.53■■□□□ 1.04
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TMUB2-201ENST00000319511 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.39■■□□□ 1.01
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TMUB2-201ENST00000319511 SLC24A1O60721 1099 aa21.08■□□□□ 0.96
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TMUB2-201ENST00000319511 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.99■□□□□ 0.95
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TMUB2-201ENST00000319511 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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TMUB2-201ENST00000319511 SMARCA2P51531 1590 aa20.4■□□□□ 0.86
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TMUB2-201ENST00000319511 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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TMUB2-201ENST00000319511 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.28■□□□□ 0.84
TMUB2-201ENST00000319511 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMUB2-201ENST00000319511 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.22■□□□□ 0.83
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TMUB2-201ENST00000319511 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.16■□□□□ 0.82
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TMUB2-201ENST00000319511 EEA1Q15075 1411 aa19.81■□□□□ 0.76
TMUB2-201ENST00000319511 SYNJ1O43426 1573 aa19.8■□□□□ 0.76
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TMUB2-201ENST00000319511 TOP2BQ02880 1626 aa19.69■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 PRDM2Q13029 1718 aa19.67■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.67■□□□□ 0.74
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TMUB2-201ENST00000319511 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.63■□□□□ 0.73
TMUB2-201ENST00000319511 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.59■□□□□ 0.73
TMUB2-201ENST00000319511 KIF21BO75037 1637 aa19.58■□□□□ 0.73
TMUB2-201ENST00000319511 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.58■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 GOLGA3Q08378 1498 aa19.56■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 CUX1P39880 1505 aa19.52■□□□□ 0.72
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TMUB2-201ENST00000319511 CEP162Q5TB80 1403 aa19.49■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.48■□□□□ 0.71
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TMUB2-201ENST00000319511 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.46■□□□□ 0.71
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TMUB2-201ENST00000319511 KIF27Q86VH2 1401 aa19.29■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.26■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 ERCC6Q03468 1493 aa19.26■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.23■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 NESP48681 1621 aa19.23■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 CLIP1P30622 1438 aa19.23■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.22■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.21■□□□□ 0.67
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