RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441883.5

MRPL28-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL28, Length 800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28-204ENST00000441883 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.26■■■■■ 8.36
MRPL28-204ENST00000441883 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.1■■■■■ 7.21
MRPL28-204ENST00000441883 ABCC9O60706 1549 aa59.7■■■■■ 7.15
MRPL28-204ENST00000441883 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.99■■■■■ 6.71
MRPL28-204ENST00000441883 NACADO15069 1562 aa56.74■■■■■ 6.67
MRPL28-204ENST00000441883 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.56■■■■■ 6.64
MRPL28-204ENST00000441883 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.13■■■■■ 6.58
MRPL28-204ENST00000441883 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.82■■■■■ 6.53
MRPL28-204ENST00000441883 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.76■■■■■ 6.52
MRPL28-204ENST00000441883 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.73■■■■■ 6.51
MRPL28-204ENST00000441883 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.7■■■■■ 6.517e-7■■■■■ 27.2
MRPL28-204ENST00000441883 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.58■■■■■ 6.49
MRPL28-204ENST00000441883 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.4■■■■■ 6.46
MRPL28-204ENST00000441883 SCRIBQ14160 1630 aa54.8■■■■■ 6.36
MRPL28-204ENST00000441883 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.6■■■■■ 6.33
MRPL28-204ENST00000441883 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.95■■■■■ 6.23
MRPL28-204ENST00000441883 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.95■■■■■ 6.23
MRPL28-204ENST00000441883 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.72■■■■■ 6.19
MRPL28-204ENST00000441883 NCAPD3P42695 1498 aa52.43■■■■■ 5.98
MRPL28-204ENST00000441883 SMARCA4P51532 1647 aa52.34■■■■■ 5.97
MRPL28-204ENST00000441883 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.31■■■■■ 5.97
MRPL28-204ENST00000441883 SMARCA2P51531 1590 aa52.14■■■■■ 5.94
MRPL28-204ENST00000441883 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.14■■■■■ 5.94
MRPL28-204ENST00000441883 HMGXB3Q12766 1538 aa52.01■■■■■ 5.92
MRPL28-204ENST00000441883 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.86■■■■■ 5.89
MRPL28-204ENST00000441883 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.85■■■■■ 5.89
MRPL28-204ENST00000441883 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
MRPL28-204ENST00000441883 ERCC6Q03468 1493 aa51.45■■■■■ 5.83
MRPL28-204ENST00000441883 NESP48681 1621 aa51.45■■■■■ 5.83
MRPL28-204ENST00000441883 CUX2O14529 1486 aa51.23■■■■■ 5.79
MRPL28-204ENST00000441883 WIZO95785 1651 aa51.23■■■■■ 5.79
MRPL28-204ENST00000441883 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.11■■■■■ 5.77
MRPL28-204ENST00000441883 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.95■■■■■ 5.75
MRPL28-204ENST00000441883 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.83■■■■■ 5.73
MRPL28-204ENST00000441883 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.8■■■■■ 5.72
MRPL28-204ENST00000441883 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.79■■■■■ 5.72
MRPL28-204ENST00000441883 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.78■■■■■ 5.72
MRPL28-204ENST00000441883 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.76■■■■■ 5.72
MRPL28-204ENST00000441883 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.59■■■■■ 5.69
MRPL28-204ENST00000441883 CFTRP13569 1480 aa50.35■■■■■ 5.65
MRPL28-204ENST00000441883 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.33■■■■■ 5.65
MRPL28-204ENST00000441883 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.23■■■■■ 5.63
MRPL28-204ENST00000441883 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.21■■■■■ 5.63
MRPL28-204ENST00000441883 WDR62O43379 1518 aa50.21■■■■■ 5.63
MRPL28-204ENST00000441883 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.06■■■■■ 5.6
MRPL28-204ENST00000441883 PRDM2Q13029 1718 aa49.82■■■■■ 5.57
MRPL28-204ENST00000441883 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
MRPL28-204ENST00000441883 TOPBP1Q92547 1522 aa49.34■■■■■ 5.49
MRPL28-204ENST00000441883 ABCC8Q09428 1581 aa49.24■■■■■ 5.47
MRPL28-204ENST00000441883 IFT140Q96RY7 1462 aa49.21■■■■■ 5.47
MRPL28-204ENST00000441883 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.18■■■■■ 5.46
MRPL28-204ENST00000441883 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.13■■■■■ 5.45
MRPL28-204ENST00000441883 OSCARQ8IYS5 282 aa49.02■■■■■ 5.44
MRPL28-204ENST00000441883 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
MRPL28-204ENST00000441883 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
MRPL28-204ENST00000441883 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.87■■■■■ 5.41
MRPL28-204ENST00000441883 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
MRPL28-204ENST00000441883 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.75■■■■■ 5.44e-7■■■■■ 27.1
MRPL28-204ENST00000441883 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.7■■■■■ 5.39
MRPL28-204ENST00000441883 TRIM41Q8WV44 630 aa48.67■■■■■ 5.38
MRPL28-204ENST00000441883 CUX1P39880 1505 aa48.67■■■■■ 5.38
MRPL28-204ENST00000441883 SOGA1O94964 1423 aa48.66■■■■■ 5.38
MRPL28-204ENST00000441883 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.62■■■■■ 5.37
MRPL28-204ENST00000441883 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
MRPL28-204ENST00000441883 CHD1O14646 1710 aa48.39■■■■■ 5.34
MRPL28-204ENST00000441883 WDR97A6NE52 1622 aa48.36■■■■■ 5.33
MRPL28-204ENST00000441883 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.31■■■■■ 5.32
MRPL28-204ENST00000441883 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.31■■■■■ 5.32
MRPL28-204ENST00000441883 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.31■■■■■ 5.32
MRPL28-204ENST00000441883 FBLN2P98095 1184 aa48.29■■■■■ 5.32
MRPL28-204ENST00000441883 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.22■■■■■ 5.31
MRPL28-204ENST00000441883 ARHGEF11O15085 1522 aa48.21■■■■■ 5.31
MRPL28-204ENST00000441883 GRIN2BQ13224 1484 aa48.16■■■■■ 5.3
MRPL28-204ENST00000441883 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.1■■■■■ 5.29
MRPL28-204ENST00000441883 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.1■■■■■ 5.29
MRPL28-204ENST00000441883 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.06■■■■■ 5.28
MRPL28-204ENST00000441883 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.02■■■■■ 5.28
MRPL28-204ENST00000441883 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.01■■■■■ 5.28
MRPL28-204ENST00000441883 TOP2BQ02880 1626 aa47.99■■■■■ 5.27
MRPL28-204ENST00000441883 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.99■■■■■ 5.27
MRPL28-204ENST00000441883 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.98■■■■■ 5.27
MRPL28-204ENST00000441883 PBRM1Q86U86 1689 aa47.98■■■■■ 5.27
MRPL28-204ENST00000441883 SYNJ1O43426 1573 aa47.96■■■■■ 5.27
MRPL28-204ENST00000441883 SYNJ2O15056 1496 aa47.95■■■■■ 5.27
MRPL28-204ENST00000441883 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.87■■■■■ 5.25
MRPL28-204ENST00000441883 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.86■■■■■ 5.25
MRPL28-204ENST00000441883 ARAP1Q96P48 1450 aa47.78■■■■■ 5.24
MRPL28-204ENST00000441883 ADAMTS12P58397 1594 aa47.56■■■■■ 5.2
MRPL28-204ENST00000441883 GRIN2AQ12879 1464 aa47.55■■■■■ 5.2
MRPL28-204ENST00000441883 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.49■■■■■ 5.19
MRPL28-204ENST00000441883 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.47■■■■■ 5.19
MRPL28-204ENST00000441883 NUP160Q12769 1436 aa47.39■■■■■ 5.18
MRPL28-204ENST00000441883 CEP170Q5SW79 1584 aa47.37■■■■■ 5.17
MRPL28-204ENST00000441883 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.2■■■■■ 5.15
MRPL28-204ENST00000441883 SHROOM2Q13796 1616 aa47.12■■■■■ 5.13
MRPL28-204ENST00000441883 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
MRPL28-204ENST00000441883 KIF27Q86VH2 1401 aa47.06■■■■■ 5.12
MRPL28-204ENST00000441883 IGF1RP08069 1367 aa47.06■■■■■ 5.12
MRPL28-204ENST00000441883 JPH4Q96JJ6 628 aa46.94■■■■■ 5.1
MRPL28-204ENST00000441883 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
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