RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589184.5

TMUB2-211, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-211ENST00000589184 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.98■■■□□ 2.55
TMUB2-211ENST00000589184 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.76■■□□□ 1.87
TMUB2-211ENST00000589184 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TMUB2-211ENST00000589184 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.67■■□□□ 1.7
TMUB2-211ENST00000589184 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.63■■□□□ 1.69
TMUB2-211ENST00000589184 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.42■■□□□ 1.66
TMUB2-211ENST00000589184 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
TMUB2-211ENST00000589184 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TMUB2-211ENST00000589184 NACADO15069 1562 aa24.82■■□□□ 1.56
TMUB2-211ENST00000589184 ABCC9O60706 1549 aa24.74■■□□□ 1.55
TMUB2-211ENST00000589184 SCRIBQ14160 1630 aa24.63■■□□□ 1.53
TMUB2-211ENST00000589184 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.45■■□□□ 1.51
TMUB2-211ENST00000589184 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-211ENST00000589184 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TMUB2-211ENST00000589184 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.97■■□□□ 1.43
TMUB2-211ENST00000589184 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB2-211ENST00000589184 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TMUB2-211ENST00000589184 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.87■■□□□ 1.41
TMUB2-211ENST00000589184 WIZO95785 1651 aa23.74■■□□□ 1.39
TMUB2-211ENST00000589184 SMARCA4P51532 1647 aa23.68■■□□□ 1.38
TMUB2-211ENST00000589184 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.62■■□□□ 1.37
TMUB2-211ENST00000589184 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TMUB2-211ENST00000589184 TRIM41Q8WV44 630 aa23.52■■□□□ 1.36
TMUB2-211ENST00000589184 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.343e-6■■■□□ 16
TMUB2-211ENST00000589184 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.39■■□□□ 1.33
TMUB2-211ENST00000589184 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TMUB2-211ENST00000589184 SMARCA2P51531 1590 aa23.34■■□□□ 1.33
TMUB2-211ENST00000589184 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.33■■□□□ 1.33
TMUB2-211ENST00000589184 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.31■■□□□ 1.32
TMUB2-211ENST00000589184 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.16■■□□□ 1.3
TMUB2-211ENST00000589184 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
TMUB2-211ENST00000589184 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TMUB2-211ENST00000589184 ABCC8Q09428 1581 aa22.97■■□□□ 1.27
TMUB2-211ENST00000589184 EEA1Q15075 1411 aa22.9■■□□□ 1.26
TMUB2-211ENST00000589184 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.9■■□□□ 1.26
TMUB2-211ENST00000589184 HMGXB3Q12766 1538 aa22.9■■□□□ 1.26
TMUB2-211ENST00000589184 NCAPD3P42695 1498 aa22.89■■□□□ 1.25
TMUB2-211ENST00000589184 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
TMUB2-211ENST00000589184 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TMUB2-211ENST00000589184 HRCP23327 699 aa22.76■■□□□ 1.23
TMUB2-211ENST00000589184 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.75■■□□□ 1.23
TMUB2-211ENST00000589184 SOGA1O94964 1423 aa22.69■■□□□ 1.22
TMUB2-211ENST00000589184 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.68■■□□□ 1.22
TMUB2-211ENST00000589184 SYNJ1O43426 1573 aa22.66■■□□□ 1.22
TMUB2-211ENST00000589184 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.64■■□□□ 1.22
TMUB2-211ENST00000589184 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.61■■□□□ 1.21
TMUB2-211ENST00000589184 TOP2BQ02880 1626 aa22.57■■□□□ 1.2
TMUB2-211ENST00000589184 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TMUB2-211ENST00000589184 GOLGA3Q08378 1498 aa22.56■■□□□ 1.2
TMUB2-211ENST00000589184 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.53■■□□□ 1.2
TMUB2-211ENST00000589184 CFTRP13569 1480 aa22.53■■□□□ 1.2
TMUB2-211ENST00000589184 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.52■■□□□ 1.2
TMUB2-211ENST00000589184 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.5■■□□□ 1.19
TMUB2-211ENST00000589184 KIF21BO75037 1637 aa22.5■■□□□ 1.19
TMUB2-211ENST00000589184 CEP162Q5TB80 1403 aa22.48■■□□□ 1.19
TMUB2-211ENST00000589184 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TMUB2-211ENST00000589184 PRDM2Q13029 1718 aa22.43■■□□□ 1.18
TMUB2-211ENST00000589184 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.4■■□□□ 1.18
TMUB2-211ENST00000589184 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.35■■□□□ 1.17
TMUB2-211ENST00000589184 CUX1P39880 1505 aa22.34■■□□□ 1.17
TMUB2-211ENST00000589184 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
TMUB2-211ENST00000589184 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
TMUB2-211ENST00000589184 KIF27Q86VH2 1401 aa22.25■■□□□ 1.15
TMUB2-211ENST00000589184 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.21■■□□□ 1.15
TMUB2-211ENST00000589184 CLIP1P30622 1438 aa22.2■■□□□ 1.14
TMUB2-211ENST00000589184 PRXQ9BXM0 1461 aa22.19■■□□□ 1.14
TMUB2-211ENST00000589184 MYT1Q01538 1121 aa22.13■■□□□ 1.13
TMUB2-211ENST00000589184 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TMUB2-211ENST00000589184 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.1■■□□□ 1.13
TMUB2-211ENST00000589184 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.08■■□□□ 1.13
TMUB2-211ENST00000589184 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.02■■□□□ 1.12
TMUB2-211ENST00000589184 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.01■■□□□ 1.11
TMUB2-211ENST00000589184 CUX2O14529 1486 aa22.01■■□□□ 1.11
TMUB2-211ENST00000589184 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22■■□□□ 1.11
TMUB2-211ENST00000589184 APLP2Q06481 763 aa21.99■■□□□ 1.11
TMUB2-211ENST00000589184 IGF1RP08069 1367 aa21.95■■□□□ 1.1
TMUB2-211ENST00000589184 TOPBP1Q92547 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
TMUB2-211ENST00000589184 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.88■■□□□ 1.09
TMUB2-211ENST00000589184 NESP48681 1621 aa21.87■■□□□ 1.09
TMUB2-211ENST00000589184 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.87■■□□□ 1.09
TMUB2-211ENST00000589184 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.87■■□□□ 1.09
TMUB2-211ENST00000589184 ARAP1Q96P48 1450 aa21.86■■□□□ 1.09
TMUB2-211ENST00000589184 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TMUB2-211ENST00000589184 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TMUB2-211ENST00000589184 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TMUB2-211ENST00000589184 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TMUB2-211ENST00000589184 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.76■■□□□ 1.07
TMUB2-211ENST00000589184 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TMUB2-211ENST00000589184 CUL7Q14999 1698 aa21.75■■□□□ 1.07
TMUB2-211ENST00000589184 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.74■■□□□ 1.07
TMUB2-211ENST00000589184 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TMUB2-211ENST00000589184 WDR97A6NE52 1622 aa21.68■■□□□ 1.06
TMUB2-211ENST00000589184 MAP3K1Q13233 1512 aa21.65■■□□□ 1.06
TMUB2-211ENST00000589184 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.62■■□□□ 1.05
TMUB2-211ENST00000589184 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.61■■□□□ 1.05
TMUB2-211ENST00000589184 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.6■■□□□ 1.05
TMUB2-211ENST00000589184 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.6■■□□□ 1.05
TMUB2-211ENST00000589184 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.57■■□□□ 1.04
TMUB2-211ENST00000589184 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TMUB2-211ENST00000589184 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms