Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MGAT4B-219ENST00000522293 759 ntTSL 313.51□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-227ENST00000529473 3016 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-225ENST00000526491 3091 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 GTF3C1-203ENST00000562609 2824 ntTSL 513.06□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-207ENST00000573450 579 ntTSL 213.01□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CLCN7-205ENST00000563642 4184 ntTSL 212.92□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-205ENST00000424768 1147 ntTSL 412.74□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AP3S1-207ENST00000514118 392 ntTSL 512.38□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-203ENST00000393618 592 ntTSL 412.34□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SLC8B1-211ENST00000550672 2925 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-205ENST00000437030 566 ntTSL 512.13□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 312.05□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-209ENST00000587442 464 ntTSL 311.9□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 511.83□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 211.64□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 211.51□□□□□ -0.575e-11■■■■■ 34.8
DDX6P26196 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 211.29□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-206ENST00000441045 589 ntTSL 411.15□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-210ENST00000459775 2148 ntTSL 210.54□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-214ENST00000474572 293 ntTSL 49.77□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 VKORC1-208ENST00000498155 870 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-216ENST00000550958 706 ntTSL 39.66□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 49.51□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-204ENST00000417537 300 ntTSL 49.3□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-213ENST00000491027 1009 ntTSL 29.01□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -15e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MGAT4B-207ENST00000518980 983 ntTSL 58.18□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-212ENST00000489732 1976 ntTSL 27.69□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-210ENST00000486949 1115 ntTSL 26.25□□□□□ -1.415e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AP3S1-202ENST00000395548 1180 ntTSL 1 (best)5.68□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-215ENST00000549780 801 ntTSL 55.67□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-212ENST00000549253 563 ntTSL 35.34□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-214ENST00000549546 820 ntTSL 55.31□□□□□ -1.565e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-211ENST00000489358 581 ntTSL 35.21□□□□□ -1.585e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 221.6■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 34.7
DDX6P26196 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■■■■ 34.7
DDX6P26196 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 34.7
DDX6P26196 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 34.7
DDX6P26196 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 34.7
DDX6P26196 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.413e-10■■■■■ 34.6
DDX6P26196 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 34.6
DDX6P26196 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 34.6
DDX6P26196 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 34.6
DDX6P26196 AC068768.1-202ENST00000541002 1110 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.73e-10■■■■■ 34.6
DDX6P26196 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 518.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-31■■■■■ 34.6
DDX6P26196 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.671e-31■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-218ENST00000531933 583 ntTSL 310.55□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-31■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 34.6
DDX6P26196 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.291e-31■■■■■ 34.6
DDX6P26196 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-31■■■■■ 34.6
DDX6P26196 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-227ENST00000526570 5528 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 34.4
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